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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000493`

染色体: Chr04 坐标: 5384322-5389410 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000493`
名称	SmilChr04G000493
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5384322 - 5389410 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022893`
GeneID	`131022893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022893`
原始查询	`LOC131022893`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=26.5; qcov=0.845; evalue=8.26e-43; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=26.7; qcov=0.841; evalue=5.44e-46; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004803 (transposase activity); GO:0006313 (DNA transposition); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808419.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808419.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808419.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808419.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5384447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B82,D2
`Chr4:5384459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C1,C6,C65
`Chr4:5384561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5384570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B42,B43
`Chr4:5384609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C33
`Chr4:5384780`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B10,B102,B134,B65,B77,D10
`Chr4:5384789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:5384804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:5384851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B35,C20
`Chr4:5384873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:5384892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B91
`Chr4:5384976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B25,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808419.1

464 aa

232

464

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 222-305 aa PF00872 Transposase_mut 244-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808419.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	222	305	6.6e-20	72.0	MULE transposase domain
`XP_057808419.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	244	404	1.2e-05	25.1	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952436.1
ATGTTTGCACTTCACATATATCCGGCGTATGAAGAAGATGAAACAGTTGAACTTACAATCCCTGAATGCGAGTCTAAGAGCAAACCCTTTGTGGGGCAGATTTTTCCAAATTTGGATGTAGGATGTGAGTTTTACGACGATTATGCAGAGTTATGCGGTTTTACATCCAGAAAAAGCACAAGCACAAAGGATGATGATGATTTTGGTATGTATAAGGTGCGCACGTTCATTGAGGGTCATAATCACGCCATGGTTCCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022893
ATGTTTGCACTTCACATATATCCGGCGTATGAAGAAGATGAAACAGTTGAACTTACAATCCCTGAATGCGAGTCTAAGAGCAAACCCTTTGTGGGGCAGATTTTTCCAAATTTGGATGTAGGATGTGAGTTTTACGACGATTATGCAGAGTTATGCGGTTTTACATCCAGAAAAAGCACAAGCACAAAGGATGATGATGATTTTGGTATGTATAAGGTGCGCACGTTCATTGAGGGTCATAATCACGCCATGGTTCCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808419.1
MFALHIYPAYEEDETVELTIPECESKSKPFVGQIFPNLDVGCEFYDDYAELCGFTSRKSTSTKDDDDFGMYKVRTFIEGHNHAMVPTVSRHLMPVNRNVTPVHEMWITSAIKANIGPIRSFRMYREIMGECEDIGCVSNDFKNFVRDLNVYALDSDAHMILQTFMNKKELGNGFQYFYDVDDENRLRRLIWTDEVSVKNYKYLVKLCPSTQHTIPTVIGNCSNRYKMIFTPFTGRDNHGKCLSFGAAIISREDVDSYSWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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