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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000504`

染色体: Chr04 坐标: 5502055-5504407 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000504`
名称	SmilChr04G000504
描述	(+)-borneol dehydrogenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5502055 - 5504407 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022895`
GeneID	`131022895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022895`
原始查询	`LOC131022895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(+)-borneol dehydrogenase 2-like
产物	(+)-borneol dehydrogenase 2-like
Arabidopsis	`AT1G52340` (ABA2) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841665] identity=58.6; qcov=0.873; evalue=1.07e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0810800` (OsABA2) - identity=58.3; qcov=0.899; evalue=1.25e-101; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0009688 (abscisic acid biosynthetic process); GO:0010301 (xanthoxin dehydrogenase (NAD+) activity)
KEGG	smil00906 (Carotenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808421.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808421.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057808421.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808421.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5502073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C74
`Chr4:5502137`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B120,B127,B133,B55,B62,C17,C35
`Chr4:5502138`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B120,B127,B133,B55,B62,C17,C35
`Chr4:5502205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:5502207`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	80	A11,A13,A14,A16,A24,A25,B1,B10,B102,B104,B106,B109,B115,B117,B126,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B17,B18,B24,B25,B27,B28,B32,B34,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B48,B50,B57,B60,B63,B65,B68,B71,B72,B77,B78,B8,B83,B86,B91,B94,B98,C10,C11,C12,C18,C22,C25,C27,C32,C33,C34,C42,C44,C45,C48,C51,C52,C55,C56,C61,C63,C68,C69,C70,C79,C86,D5
`Chr4:5502334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:5502369`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B13,B135,B54,C19,C53,C54,C58,D4
`Chr4:5502380`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A9,C30,C51
`Chr4:5502380`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A9,C30,C51
`Chr4:5502388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C73
`Chr4:5502410`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr4:5502410`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808421.1

307 aa

154

307

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 37-228 aa PF08659 KR 40-151 aa PF13561 adh_short_C2 45-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808421.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	37	228	4.8e-53	180.3	short chain dehydrogenase
`XP_057808421.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	40	151	2.3e-09	38.2	KR domain
`XP_057808421.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	45	291	7.6e-60	203.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952438.1
ATGGCTTCAAGAAGCACAGCCCAATCCGATCACTCTCTTCGCTCACAAAGCATCTTCGAAGCTCTTGAAACATTGATCTTTTACGTGACTCCACCCAGGTTACTAGGCAAAGTTGCAGTGGTTACGGGAGGTGCTAGCGGCATTGGAGAGAGCATCGTTCGTTCGTTCCTCAAACACGGCGCCAAGGTCTGCGTGGCCGACATTCAAGACAACGTTGGCCACCGCCTAGTCGAAAGCCTCAGCCACGACGGCTTTGACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022895
ATGGCTTCAAGAAGCACAGCCCAATCCGATCACTCTCTTCGCTCACAAAGCATCTTCGAAGCTCTTGAAACATTGATCTTTTACGTGACTCCACCCAGGTTACTAGGCAAAGTTGCAGTGGTTACGGGAGGTGCTAGCGGCATTGGAGAGAGCATCGTTCGTTCGTTCCTCAAACACGGCGCCAAGGTCTGCGTGGCCGACATTCAAGACAACGTTGGCCACCGCCTAGTCGAAAGCCTCAGCCACGACGGCTTTGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808421.1
MASRSTAQSDHSLRSQSIFEALETLIFYVTPPRLLGKVAVVTGGASGIGESIVRSFLKHGAKVCVADIQDNVGHRLVESLSHDGFDVSYGHCDVTIEEDVKHAVDTAVDKYGGLDIMVNNAGIAGSFAPDVRHVNISDFERVMDVNVKGVFSGMKHAARAMIPAGKKGSIVSTCNIAGVVGGGPHAYTASKHAVLGLTRSAAGELGRHGIRVNCVSPYCVITGMASALVPEGKRDAEEKFLAALDRAIVAGANLKGVALT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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