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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000559`

染色体: Chr04 坐标: 6256977-6258392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000559`
名称	SmilChr04G000559
描述	uncharacterized SmilChr04G000559
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6256977 - 6258392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022903`
GeneID	`131022903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022903`
原始查询	`LOC131022903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808429.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808429.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808429.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808429.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6256998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B38,C42
`Chr4:6257049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B18,B38
`Chr4:6257266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A8,B101,B114,B125,B134,B138,B17,B18,B23,B27,B30,B34,B36,B44,B48,B49,B66,B69,B70,B80,B85,B88,B9,B96,C13,C17,C23,C24,C26,C34,C35,C38,C41,C63,C87,D5
`Chr4:6257294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B44,B84,C48
`Chr4:6257303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B124,B79,C52,C56
`Chr4:6257439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B26,B37
`Chr4:6257477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A15,A25,A4,B1,B102,B111,B115,B123,B127,B128,B14,B18,B19,B24,B27,B29,B38,B39,B4,B46,B47,B52,B54,B62,B63,B65,B68,B87,B9,B98,C17,C22,C26,C28,C42,C45,C49,C61,C64,C66,C74,C77,C8,C85,D6,D7
`Chr4:6257530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr4:6257616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr4:6257680`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B27,C22,C28,C85
`Chr4:6257680`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B27,C22,C28,C85
`Chr4:6257814`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A2,A22,A8,B119,B129,B24,B42,B47,B54,B64,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808429.1

358 aa

179

358

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 138-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808429.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	138	269	2e-13	51.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952446.1
ATGTCTACTTCTGACCGATCCGGATCTACGCATTCGACCGACGATCCGGATGTGTCCGTGACGCCGCCCACGGGGGCTATACCGACTGGTGTTGCTACTGATGGGCGCACATGGGTGCATCTTCATGGCAGGCCGAGTGGACCTATTCGGGCTAGGGCTACTGATAGCTTCCAAGGTATGCCACATGAAAGTGGCACGAATTGGAAGAATTTAACTGAAGAGATGAAGGACGTGTACTTCGACGAATTTGAGAAAGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022903
ATGTCTACTTCTGACCGATCCGGATCTACGCATTCGACCGACGATCCGGATGTGTCCGTGACGCCGCCCACGGGGGCTATACCGACTGGTGTTGCTACTGATGGGCGCACATGGGTGCATCTTCATGGCAGGCCGAGTGGACCTATTCGGGCTAGGGCTACTGATAGCTTCCAAGGTATGCCACATGAAAGTGGCACGAATTGGAAGAATTTAACTGAAGAGATGAAGGACGTGTACTTCGACGAATTTGAGAAAGCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808429.1
MSTSDRSGSTHSTDDPDVSVTPPTGAIPTGVATDGRTWVHLHGRPSGPIRARATDSFQGMPHESGTNWKNLTEEMKDVYFDEFEKAFCWQQDKYTRHQIKKAWISEARVAYKDYISACKKTLLLHKKKIDYLNPIVEAAWRAYWALPETQARSAQASRNRRKEPCGVGTGMAIHHGGSRSALDHAEYLARESNIPLDAASWATFRRIHFKNGQYTAGRPAQHGLEVERRVAELREIQGEVTPADVDRIFREVVTPDLKGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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