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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002032`

染色体: Chr01 坐标: 35927524-35930502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002032`
名称	SmilChr01G002032
描述	U-box domain-containing protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35927524 - 35930502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022909`
GeneID	`131022909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022909`
原始查询	`LOC131022909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 9-like
产物	U-box domain-containing protein 9-like
Arabidopsis	`AT3G07360` (PUB9) plant U-box 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819924] identity=52.1; qcov=1.03; evalue=6.98e-165; confidence=high
Rice	`Os02g0488600` (OsPUB8) - identity=46.4; qcov=0.842; evalue=5.36e-127; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF04564 (U-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808437.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808437.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808437.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808437.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35928813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808437.1

456 aa

228

456

U-box

PF04564 U-box 75-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808437.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	75	143	2.1e-22	79.7	U-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952454.1
TAAAGAGTTGTAGATTGCCAGCTGTCCAGCCATGGATGAGTGATTGCGTAACCCAGGCTGCTCCTCGTCTCGTCTCGTCTCGTCTCGTCCATGACCACGCCTTTCTCTACAAAACCCCAAAACCAAAACCATCACCCACCACTTAACTCTCTCATTCGTATTCCACACTTCACTCACAACACAACCCCGCTTTCCTCAGACACAGTGAGAAAATTGTGTGAATCATATGCCGCGGGTTGCGGAGGGCTGAGTTGATATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022909
ATGGCCAAGAGCGGGGTGTTCGAAGGGGATCGGGTGATGGTGGTCAAGGCCGTGGAGTTGAGGAAGGAGCTGCAGAAGCTGTTGAGGGCGATTGTGGAGGAGGACGACGTCAATCTGGAGGCGCTCGATAGGGCGCAGCAAATGCTCTTGCTGTTGAAGGAATTGAAGCTCAAGAAGACGGCTGATTTGGAGCTCCGCCGTCAGGATGTCATCCCCGCCACGGTGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCCGCTCTCCAAGAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808437.1
MAKSGVFEGDRVMVVKAVELRKELQKLLRAIVEEDDVNLEALDRAQQMLLLLKELKLKKTADLELRRQDVIPATVPEEFKCPLSKKLMRDPVILSTGVTYDRPFIQNWLKSGKRTCPKTEQVLSHTVLIPNHLIREMITNWCKIRGIELPECKYNDEEAYSEEDQEAFKSLLEKMSSTLFEQKEAAKKLRQLTKRTPSIRVLFADRENAVSQLVAPFAQPNIQDHPDLQEDIITTILNISIHDNNKKRVAETPTVIPILK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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