当前解析结果
SmilChr04G000618| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000618 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000618 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000618 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 6991094 - 6991486 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022913 |
|---|---|
| GeneID | 131022913 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022913 |
| 原始查询 | LOC131022913 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022913 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808438.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808438.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057808438.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808438.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808438.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:6991108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 157 | A1,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B101,B107,B108,B109,B115,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B25,B27,B3,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B5,B51,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B99,C10,C11,C13,C14,C18,C19,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C42,C43,C46,C47,C49,C50,C51,C53,C55,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C83,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9 |
Chr4:6991121 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 48 | A1,A19,A9,B110,B111,B112,B114,B127,B133,B135,B139,B14,B15,B27,B39,B41,B44,B45,B49,B51,B66,B71,B72,B74,B77,B79,B89,B90,B99,C10,C12,C21,C26,C29,C37,C40,C45,C6,C63,C71,C72,C73,C74,C76,C80,C84,C87,D2 |
Chr4:6991129 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 65 | A1,A4,B10,B102,B103,B104,B110,B111,B112,B113,B126,B127,B128,B13,B133,B134,B137,B14,B22,B27,B29,B33,B35,B37,B39,B41,B44,B50,B51,B61,B64,B66,B70,B79,B8,B81,B83,B87,B88,B89,B9,B95,B99,C10,C12,C15,C18,C24,C26,C29,C31,C37,C40,C45,C49,C51,C54,C59,C6,C60,C74,C87,D2,D6,D9 |
Chr4:6991136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A1,B112,B127,B133,B14,B27,B32,B39,B41,B44,B51,B66,B89,B99,C10,C26,C29,C37,C6,C74,C87,D2 |
Chr4:6991147 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,B136 |
Chr4:6991153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,B136 |
Chr4:6991166 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:6991169 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A3,B115,B131,B78,C18,C2,C35 |
Chr4:6991220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr4:6991220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:6991229 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 47 | A15,A25,A9,B110,B111,B114,B115,B120,B124,B135,B139,B14,B19,B24,B26,B45,B53,B6,B60,B71,B72,B74,B77,B79,B8,B87,B88,B89,C21,C30,C33,C37,C44,C45,C52,C60,C63,C67,C72,C73,C8,C82,C84,C85,C86,D1,D3 |
Chr4:6991231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B34,C28 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。