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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000649`

染色体: Chr04 坐标: 7346582-7347817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000649`
名称	SmilChr04G000649
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7346582 - 7347817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022921`
GeneID	`131022921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022921`
原始查询	`LOC131022921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=36.7; qcov=0.908; evalue=4.74e-77; confidence=medium
Rice	`Os01g0852650` - identity=51.4; qcov=0.866; evalue=1.83e-131; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808445.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808445.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808445.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808445.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808445.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7346607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B113,B44,C16
`Chr4:7346697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B5,C2,C3
`Chr4:7346727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:7346728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B28,B5,C2,C3
`Chr4:7346762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:7346792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7346805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C13
`Chr4:7346869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B113,B44,C16
`Chr4:7346943`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	89	A10,A15,A19,A20,A24,A25,A4,A7,B1,B100,B101,B102,B109,B11,B110,B115,B118,B123,B127,B129,B13,B130,B131,B135,B136,B138,B14,B140,B16,B17,B2,B22,B26,B28,B3,B30,B34,B35,B42,B43,B45,B46,B47,B50,B51,B53,B56,B59,B61,B62,B63,B71,B73,B81,B83,B84,B85,B88,B89,B9,B93,B96,B99,C10,C14,C18,C19,C23,C26,C30,C32,C35,C37,C38,C45,C54,C55,C58,C62,C67,C68,C72,C73,C74,C81,C82,D4,D6,D9
`Chr4:7346970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:7346999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B10,B28,B5,C2,C3
`Chr4:7346999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B28,B5,C2,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808445.1

411 aa

206

411

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 63-149 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 237-353 aa PF10551 MULE 272-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808445.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	63	149	1.3e-19	71.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057808445.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	237	353	8.4e-13	49.1	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057808445.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	272	366	1.3e-26	93.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952462.1
ATGGAAAGCGGATCAGTATCTTGCCGTCGCTTGAGTTTTGAAGATGTTAATGAAAAACATATTCAACATGTCAATGATAAGATTGATGATCAGAACAACAATCAGTTGGCGATTGCTACAAGTATGTTCAATGTGGAAGATATTTCGAAAATTGGGATGAGCTTTGACACTGAACAAGAAGCTTATGACTTTTATTTAAAGTATTCAAAACGTGTGGGTTTTGGTATAAGAAAGAGCAAGAGCCATAATGACAAATTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022921
ATGGAAAGCGGATCAGTATCTTGCCGTCGCTTGAGTTTTGAAGATGTTAATGAAAAACATATTCAACATGTCAATGATAAGATTGATGATCAGAACAACAATCAGTTGGCGATTGCTACAAGTATGTTCAATGTGGAAGATATTTCGAAAATTGGGATGAGCTTTGACACTGAACAAGAAGCTTATGACTTTTATTTAAAGTATTCAAAACGTGTGGGTTTTGGTATAAGAAAGAGCAAGAGCCATAATGACAAATTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808445.1
MESGSVSCRRLSFEDVNEKHIQHVNDKIDDQNNNQLAIATSMFNVEDISKIGMSFDTEQEAYDFYLKYSKRVGFGIRKSKSHNDKFGQLVDIIFCCSAQGKRMNEKHDIGVKKICPETRFDCQAKMKVSSRETGKFRVVQFVEDHNHYLSSPNKTHLHRCHRKIAPSAALQIQMANDVGIAPKASHDLMVRQVGGRENLGFIPQDYRNYLRSKRTRDTRIGDTGGVLEYLQKMQFDDSNFFYAIQVDEDDLITNIFWFDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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