当前解析结果
SmilChr01G002037| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002037 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002037 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002037 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36005384 - 36007005 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022929 |
|---|---|
| GeneID | 131022929 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022929 |
| 原始查询 | LOC131022929 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923]; symbol=AT3G07350; hit=AT3G07350; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923]; symbol=AT3G07350; hit=AT3G07350; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G07350 (AT3G07350)sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923] identity=47.3; qcov=1.06; evalue=1.68e-80; confidence=high |
| Rice | Os11g0437600- identity=38.1; qcov=1; evalue=9.58e-41; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04720 (PDDEXK_6) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022929 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808454.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808454.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808454.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808454.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808454.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:36006212 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr1:36006228 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr1:36006503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,C1,C20 |
Chr1:36006527 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B1,B35,B76,D5 |
Chr1:36006530 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr1:36006541 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr1:36006610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B1,B35,B76,D5 |
Chr1:36006770 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr1:36006830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808454.1PF04720
PDDEXK_6 62-251 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808454.1 |
Pfam | PF04720 |
PDDEXK_6 | Family | 62 | 251 | 5e-66 | 223.5 | PDDEXK-like family of unknown function |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。