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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000702`

染色体: Chr04 坐标: 8171805-8173061 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000702`
名称	SmilChr04G000702
描述	FBD-associated F-box protein At3g52670-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8171805 - 8173061 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022937`
GeneID	`131022937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022937`
原始查询	`LOC131022937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FBD-associated F-box protein At3g52670-like
产物	FBD-associated F-box protein At3g52670-like
Arabidopsis	`AT3G52680` (AT3G52680) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824434] identity=25.9; qcov=1.05; evalue=1.56e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0578500` (SAF) - identity=59.5; qcov=0.152; evalue=4.38e-09; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808461.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808461.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808461.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808461.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8171860`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr4:8171860`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr4:8171949`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:8171984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:8172120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:8172210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C66,C77
`Chr4:8172359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:8172365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:8172367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48
`Chr4:8172371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C31,C6
`Chr4:8172403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48
`Chr4:8172404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808461.1

277 aa

138

277

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 21-59 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 116-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808461.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	59	3.5e-06	27.4	F-box domain
`XP_057808461.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	116	223	1.4e-07	32.0	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952478.1
ATGGGCGCGAAATTCCGGCGCAACAAGTGTTGTAAGAGACTCGATGGCGTAGTTGATAGGATAAGTGCGTTGCCTGATGATATTATCATCGCCATATTATCTCACCTATCGTTGAGGGAAGCCGCAGCCACTAGCGTTCTTGCTCCCCGATGGTCCGATTTGTGGAGACACACACCTAATCTCGACTTCAAATTATCAGCCAAATCAGCAGTCACCAGATGGCTCGAATTCGTGTTCTTAAGATCAGTTGAGAGGTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022937
ATGGGCGCGAAATTCCGGCGCAACAAGTGTTGTAAGAGACTCGATGGCGTAGTTGATAGGATAAGTGCGTTGCCTGATGATATTATCATCGCCATATTATCTCACCTATCGTTGAGGGAAGCCGCAGCCACTAGCGTTCTTGCTCCCCGATGGTCCGATTTGTGGAGACACACACCTAATCTCGACTTCAAATTATCAGCCAAATCAGCAGTCACCAGATGGCTCGAATTCGTGTTCTTAAGATCAGTTGAGAGGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808461.1
MGAKFRRNKCCKRLDGVVDRISALPDDIIIAILSHLSLREAAATSVLAPRWSDLWRHTPNLDFKLSAKSAVTRWLEFVFLRSVERLEWDFQCEDASDQIVLGEVLRESGICWGCRNLTIFTSLKSLCLKHLRVSGEDIKLFLRELPSLELLSICYANLTSHVEVCGATLALKHLEILHCKGGADISVSAPNLTWLCVDDISTLVLPLNVPKLVGAFFTYTSSASIDNVPHLISAISCCKYQLKTLNLTIRYPKWLFSNAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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