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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000712`

染色体: Chr04 坐标: 8308949-8313654 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000712`
名称	SmilChr04G000712
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8308949 - 8313654 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022942`
GeneID	`131022942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022942`
原始查询	`LOC131022942`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
产物	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
Arabidopsis	`AT4G29240` (AT4G29240) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829045] identity=44.4; qcov=0.596; evalue=9.06e-22; confidence=medium
Rice	`Os03g0795300` (OSJNBb0021G19.14) - identity=37.3; qcov=0.601; evalue=1.57e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057808465.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808465.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808465.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808465.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8308955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr4:8308962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C58,C78
`Chr4:8309023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C32,C68
`Chr4:8309044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	57	A20,A24,A25,A3,A5,B104,B110,B12,B121,B126,B129,B13,B130,B133,B14,B18,B2,B21,B26,B32,B33,B4,B40,B47,B48,B52,B61,B62,B71,B80,B82,B89,B93,B98,C12,C18,C26,C29,C31,C32,C42,C43,C48,C49,C53,C54,C58,C6,C68,C70,C72,C73,C75,C80,C86,D4,D6
`Chr4:8309048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:8309050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B24,C68
`Chr4:8309050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C68
`Chr4:8309072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B2,B71,C42,C68
`Chr4:8309113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C68
`Chr4:8309120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:8309129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C71,C72
`Chr4:8309145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952482.1
ATGACCTTTGGTCCTTCTCTATATCGAGTATCCTGCTTTAAGAATGAGGAAGACTCCGAGACTAAAGTCAATGCAGATCACAATGCAAATGATAATGAGAATGAAGAAGAAGCTGACTCTGATAATGATATGAACGAAAATGCTACAAACTATGGATCTCATGGTGATGCTAATGCTGCTGCCGACGGCATTGGAGTCGGCGGCGGCGGAAGTGTGTGGATTGGGGGCGGATTCAACCCTCCGACCTCCTCCTCCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022942
ATGACCTTTGGTCCTTCTCTATATCGAGTATCCTGCTTTAAGAATGAGGAAGACTCCGAGACTAAAGTCAATGCAGATCACAATGCAAATGATAATGAGAATGAAGAAGAAGCTGACTCTGATAATGATATGAACGAAAATGCTACAAACTATGGATCTCATGGTGATGCTAATGCTGCTGCCGACGGCATTGGAGTCGGCGGCGGCGGAAGTGTGTGGATTGGGGGCGGATTCAACCCTCCGACCTCCTCCTCCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808465.1
MTFGPSLYRVSCFKNEEDSETKVNADHNANDNENEEEADSDNDMNENATNYGSHGDANAAADGIGVGGGGSVWIGGGFNPPTSSSSAASVQRRLRRPPGLESRHFRRRLCSFKGVFCSDSVDFMGNSAGQVVAAIDLNHTILQGTLVNLNSNRFSGSVPPSFRDLASLTEFDLSKSHLSRSQSRSHLSRSQIQQFSCPFPEDLFEKKLDAIFLNNNLFSGELL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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