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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000727`

染色体: Chr04 坐标: 8532697-8533659 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000727`
名称	SmilChr04G000727
描述	uncharacterized SmilChr04G000727
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8532697 - 8533659 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022950`
GeneID	`131022950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022950`
原始查询	`LOC131022950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
产物	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G27110` (FRS3) FAR1-related sequence 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817253] identity=30.4; qcov=0.43; evalue=1.93e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0581100` (OS-CAD) - identity=27.1; qcov=0.897; evalue=2.97e-13; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808473.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808473.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808473.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808473.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8532703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,C36,C78,C87
`Chr4:8532706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D11
`Chr4:8532709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr4:8532807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B56,D11
`Chr4:8532820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B33,B74,C32
`Chr4:8532835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B50,B57
`Chr4:8532852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B33,B74,C32,C68
`Chr4:8532871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:8532900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:8532903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A5,B71
`Chr4:8532903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B71
`Chr4:8533042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B74,C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808473.1

214 aa

107

214

SWIM

PF04434 SWIM 30-53 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808473.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	30	53	0.00013	22.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952490.1
ATGTATGTGGAGGATAGCAGTAGTTTTTATGAAGTTGATGATACGGCTGATGGTGTCTCGAAGGTGTGTTACAGCTCGGTTGATGACGAGTACACATGCTCCTGTAAGTTGTTCACTAGGAAGGCTCTCCTGTGCAGACACATCTTCTTTGTTATGAGGAACAAAAAATTGACTCGCATCCCAGATAAGTACATTGATGCAAGGTGGTCAAAGTTGTCAAGAGTTGCTGCACCTCTAACTGAACATCTTTCCATTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022950
ATGTATGTGGAGGATAGCAGTAGTTTTTATGAAGTTGATGATACGGCTGATGGTGTCTCGAAGGTGTGTTACAGCTCGGTTGATGACGAGTACACATGCTCCTGTAAGTTGTTCACTAGGAAGGCTCTCCTGTGCAGACACATCTTCTTTGTTATGAGGAACAAAAAATTGACTCGCATCCCAGATAAGTACATTGATGCAAGGTGGTCAAAGTTGTCAAGAGTTGCTGCACCTCTAACTGAACATCTTTCCATTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808473.1
MYVEDSSSFYEVDDTADGVSKVCYSSVDDEYTCSCKLFTRKALLCRHIFFVMRNKKLTRIPDKYIDARWSKLSRVAAPLTEHLSIEKRFSGNNHLFLELCKSIGHVRGDSILKVQLFDDLKGLAEKYSKLGVPIDKSCKNDMFVEYYGSVRPTEVDVLPPSVVHTKGSGSGGRRKSTREKLVEQALKPKRKCKKCNRLANHDSRNCPGVDVAEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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