当前解析结果
SmilChr04G000728| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000728 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000728 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000728 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 8582907 - 8583754 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022951 |
|---|---|
| GeneID | 131022951 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022951 |
| 原始查询 | LOC131022951 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022951 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808474.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808474.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808474.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808474.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808474.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:8582906 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B126,B133,B55,C17 |
Chr4:8582958 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,B18 |
Chr4:8582980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,D10,D7,D8 |
Chr4:8582982 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B33,B44,C26 |
Chr4:8582989 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:8583022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:8583038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B108,B35,C43 |
Chr4:8583039 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B26,D5 |
Chr4:8583044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 51 | A24,A5,A7,B101,B110,B131,B136,B138,B14,B21,B22,B26,B29,B34,B36,B47,B49,B56,B60,B61,B68,B71,B72,B82,B83,B85,B88,B89,B90,B92,B93,B96,C10,C23,C29,C32,C38,C40,C42,C48,C5,C61,C68,C7,C70,C71,C73,C8,C80,C81,C86 |
Chr4:8583078 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr4:8583111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B30,B54,B58,B91,D5 |
Chr4:8583116 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B30,B54,B58,B91,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。