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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000772`

染色体: Chr04 坐标: 9485336-9486520 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000772`
名称	SmilChr04G000772
描述	uncharacterized SmilChr04G000772
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9485336 - 9486520 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022963`
GeneID	`131022963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022963`
原始查询	`LOC131022963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808486.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808486.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808486.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808486.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9485342`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	108	A1,A11,A18,A2,A20,A25,A4,A9,B1,B102,B103,B104,B108,B109,B111,B114,B115,B119,B12,B122,B123,B125,B126,B129,B131,B135,B136,B139,B14,B17,B19,B21,B26,B28,B32,B33,B34,B35,B4,B42,B43,B44,B47,B48,B5,B55,B58,B6,B60,B67,B69,B70,B71,B76,B77,B78,B79,B82,B86,B93,B94,B95,B97,C1,C12,C13,C16,C17,C19,C21,C26,C30,C31,C32,C35,C37,C39,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C60,C61,C62,C63,C68,C72,C73,C74,C76,C82,C83,D1,D10,D2,D3,D8
`Chr4:9485360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B16,B82
`Chr4:9485386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B47
`Chr4:9485402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B69
`Chr4:9485404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:9485430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:9485456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:9485473`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B124,B16,B82
`Chr4:9485473`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B124,B16,B82
`Chr4:9485530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C57,C64,C66
`Chr4:9485530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C57,C64,C66
`Chr4:9485537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808486.1

394 aa

197

394

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 175-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808486.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	175	240	4.9e-09	37.1	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952503.1
ATGAGGCCAGAGGGGAGCCGCGTCATGCTGAGTAGCATTGTCAGGAAGGAGGGGGTAGACGAGTCTGACAGTCGCTCTATCACTCCCATGTTTGAAGAGGAGAGACCAAAGGAGAACGCGAAACTAAAAAACCAGGTGTCGCAACTGAAGAACCAGCTTAAAGATCTGGAGGATACTTTGAGAGAGAAATCCCAGAGGGTCGAAAGAGTGCAGAGGTCAGAGAGATCTCACAGGGCAGAGAAATCGTACCGGTCAGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022963
ATGAGGCCAGAGGGGAGCCGCGTCATGCTGAGTAGCATTGTCAGGAAGGAGGGGGTAGACGAGTCTGACAGTCGCTCTATCACTCCCATGTTTGAAGAGGAGAGACCAAAGGAGAACGCGAAACTAAAAAACCAGGTGTCGCAACTGAAGAACCAGCTTAAAGATCTGGAGGATACTTTGAGAGAGAAATCCCAGAGGGTCGAAAGAGTGCAGAGGTCAGAGAGATCTCACAGGGCAGAGAAATCGTACCGGTCAGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808486.1
MRPEGSRVMLSSIVRKEGVDESDSRSITPMFEEERPKENAKLKNQVSQLKNQLKDLEDTLREKSQRVERVQRSERSHRAEKSYRSEKSHRSKRSHQTRRSEGREQEYSSGKQEHRVHKRHHAHNSPKKITEHGRYKDDKRARTSKTHTTTSRSPFSADILADTLPRNYKPISLDYDGTTDPEVHLSCFEGLVSLHMYIEGIKCRLFYTTLTGPAQLWFGTLAPNSIHSFEGLRTHFLRQFASSRRVGKSAISLMDIKQDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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