当前解析结果
SmilChr01G002044| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002044 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002044 |
| 描述 | U-box domain-containing protein 9-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36177883 - 36180840 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022968 |
|---|---|
| GeneID | 131022968 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022968 |
| 原始查询 | LOC131022968 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | U-box domain-containing protein 9-like |
| 产物 | U-box domain-containing protein 9-like |
| Arabidopsis | AT3G07360 (PUB9)plant U-box 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819924] identity=52.1; qcov=1.03; evalue=2.37e-164; confidence=high |
| Rice | Os02g0488600 (OsPUB8)- identity=46.4; qcov=0.842; evalue=1.47e-126; confidence=high |
| GO | GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04564 (U-box) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022968 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808494.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808494.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057808494.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808494.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808494.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808494.1PF04564
U-box 75-143 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808494.1 |
Pfam | PF04564 |
U-box | Domain | 75 | 143 | 2.2e-22 | 79.7 | U-box domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。