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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000834`

染色体: Chr04 坐标: 10476929-10478260 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000834`
名称	SmilChr04G000834
描述	uncharacterized SmilChr04G000834
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10476929 - 10478260 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022981`
GeneID	`131022981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022981`
原始查询	`LOC131022981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=26; qcov=0.381; evalue=9.95e-11; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve); PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2); PF29688 (TnsB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808504.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808504.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057808504.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808504.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10476938`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:10476938`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr4:10476939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	C33,C56,C58,C65
`Chr4:10476939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C33,C56,C58,C65
`Chr4:10476941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C26
`Chr4:10476956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B51,C46,D8
`Chr4:10476965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B135,B30,B39,C27
`Chr4:10476974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,C2,C48,C51,C79
`Chr4:10476977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C10,C79
`Chr4:10476979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B95
`Chr4:10476980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C33,D11
`Chr4:10476984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808504.1

443 aa

222

443

RVT_3

Integrase_H2C2

rve

TnsB_C

PF13456 RVT_3 46-165 aa PF17921 Integrase_H2C2 254-305 aa PF00665 rve 321-418 aa PF29688 TnsB_C 379-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808504.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	46	165	3.7e-16	59.9	Reverse transcriptase-like
`XP_057808504.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	254	305	2.3e-12	47.6	Integrase zinc binding domain
`XP_057808504.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	321	418	1.4e-18	67.7	Integrase core domain
`XP_057808504.1`	Pfam	`PF29688`	TnsB_C	Domain	379	439	2.4e-10	41.1	TnsB C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952521.1
ATGGTAAAATGGGCCATTGAATTGGGCGAATATGATGTGATGTTCGAGCCCCGTACAACCATTAAGGCGCAGGCCTTGGCTGACTTTATCCAAGAGACCACGAGATGGCCGTTGCGAGGACCATGGACGGCGCAGGTTGACGGCTCCGTCACCAAGGAGGGGTGTGGAGTCGGAATATATATCGAATCACCAGAAGATGGAGCCTACCAGTTTGTGATCAAGTTCGAGGACAAGATGTCAAACAATGAGACGGAATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022981
ATGGTAAAATGGGCCATTGAATTGGGCGAATATGATGTGATGTTCGAGCCCCGTACAACCATTAAGGCGCAGGCCTTGGCTGACTTTATCCAAGAGACCACGAGATGGCCGTTGCGAGGACCATGGACGGCGCAGGTTGACGGCTCCGTCACCAAGGAGGGGTGTGGAGTCGGAATATATATCGAATCACCAGAAGATGGAGCCTACCAGTTTGTGATCAAGTTCGAGGACAAGATGTCAAACAATGAGACGGAATATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808504.1
MVKWAIELGEYDVMFEPRTTIKAQALADFIQETTRWPLRGPWTAQVDGSVTKEGCGVGIYIESPEDGAYQFVIKFEDKMSNNETEYEAVIRAAHILKELRADTAIIKTDSQLVAQQLRGECEVRDDRMRAYYDQMQQLKEKFEELEIVQVPREENRRADLLARMASAVDQSWNNEVMLLFEPKRSPEVQVCAVEAVNDWRAPIIHFLRTGERMEGDTAKYARYENFCLISNQFYKRSFTHPFLKCLSSQEAEFALKEIHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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