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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002048`

染色体: Chr01 坐标: 36289954-36292598 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002048`
名称	SmilChr01G002048
描述	ras-related protein RABA5b-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36289954 - 36292598 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022991`
GeneID	`131022991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022991`
原始查询	`LOC131022991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABA5b-like
产物	ras-related protein RABA5b-like
Arabidopsis	`AT3G07410` (RABA5b) RAB GTPase homolog A5B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819929] identity=81.8; qcov=0.829; evalue=1.06e-125; confidence=high
Rice	`Os08g0525000` (OsRab11G2) - identity=74.4; qcov=0.818; evalue=3.01e-112; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005768 (endosome)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057808516.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057808516.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057808516.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057808516.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36290177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C87
`Chr1:36292531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C17
`Chr1:36292531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:36292547`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:36292547`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808516.1

258 aa

129

258

Arf

MMR_HSR1

Roc

Ras

PF00025 Arf 56-213 aa PF01926 MMR_HSR1 58-157 aa PF08477 Roc 58-172 aa PF00071 Ras 58-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808516.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	56	213	6.2e-15	55.8	ADP-ribosylation factor family
`XP_057808516.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	58	157	5.1e-05	24.1	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057808516.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	58	172	1.9e-34	119.1	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057808516.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	58	218	3.7e-62	209.4	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952533.1
TCGCGCGATGATGTATGCTTATTCTATTCTACTATTGTCTACCACTCCTTTCCCTCTCTTCAATAAACAAACATACAAACTCTCTTTCTCTCTTCAGCTTCCCTCACACACACTTCCACGCACAATCAAGCAGGGAACTGCAATGGCGGAGGAAGGCGGCGGGGAGGAGTATCTGTTCAAGATAGTGGTGATTGGGGATTCAGCTGTGGGCAAATCGAACTTGCTCTCGCGCTTCGCGAGGGACGAGTTCGACCACAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022991
ATGATGTATGCTTATTCTATTCTACTATTGTCTACCACTCCTTTCCCTCTCTTCAATAAACAAACATACAAACTCTCTTTCTCTCTTCAGCTTCCCTCACACACACTTCCACGCACAATCAAGCAGGGAACTGCAATGGCGGAGGAAGGCGGCGGGGAGGAGTATCTGTTCAAGATAGTGGTGATTGGGGATTCAGCTGTGGGCAAATCGAACTTGCTCTCGCGCTTCGCGAGGGACGAGTTCGACCACAACTCCAAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808516.1
MMYAYSILLLSTTPFPLFNKQTYKLSFSLQLPSHTLPRTIKQGTAMAEEGGGEEYLFKIVVIGDSAVGKSNLLSRFARDEFDHNSKATIGVEFQTQVVEVDGKEVKAQVWDTAGQERFRAVTSAYYRGAVGALIVYDITRKTTFESTKRWLDELNTHCDTAVARMLVGNKCDLENIREVSVEEGKSLAEEEGLFFIETSALDSTNVMKAFEIVIHEIYDKVSRKILNSDSYKADLSVNRVSLANGVDLSKQNKSCCSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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