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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000932`

染色体: Chr04 坐标: 12158815-12160620 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000932`
名称	SmilChr04G000932
描述	uncharacterized SmilChr04G000932
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12158815 - 12160620 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023008`
GeneID	`131023008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023008`
原始查询	`LOC131023008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808529.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808529.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808529.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808529.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12158929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:12158940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,B71,C78,C80
`Chr4:12158997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B140
`Chr4:12158997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:12159004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr4:12159098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C54,C65
`Chr4:12159119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B42,B82
`Chr4:12159132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12159133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr4:12159178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B140,B90
`Chr4:12159210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:12159246`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808529.1

601 aa

300

601

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808529.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	121	1.1e-07	32.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952546.1
ATGGAGCCTAGACAGAGGGAGAAAGAATGGAGAGAGGTCAGAAAAAGAGGGATTGATCCCAAACATGTCCAGAGAAAACCAGCAAGAAGCTGGAACCGTAATACTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGTGAAGGCACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTAGATTTTCTAAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023008
ATGGAGCCTAGACAGAGGGAGAAAGAATGGAGAGAGGTCAGAAAAAGAGGGATTGATCCCAAACATGTCCAGAGAAAACCAGCAAGAAGCTGGAACCGTAATACTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGTGAAGGCACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTAGATTTTCTAAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808529.1
MEPRQREKEWREVRKRGIDPKHVQRKPARSWNRNTLNGRRDWSSNEREGTTTFFFNNIPEDCSLDFLRRKFETVAKTVDVYCPRKRDLRGRPFGFVRFQKVERSETLLEDLNKLWIGSYKVRVYKPKFERDVEKRRNEQNSVKEKKLKQIQPCTMKVYNRHAGVSFKEALTGAKDDKELDDETFQFQTTEEDLVWLNGAFTGYIKSEFLWEEVQEEINSECAGCFKLKSLGGNMVLIQSSNEQTTEENLNKLNEWRDFWL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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