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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000962`

染色体: Chr04 坐标: 12793273-12796058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000962`
名称	SmilChr04G000962
描述	uncharacterized SmilChr04G000962
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12793273 - 12796058 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023021`
GeneID	`131023021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023021`
原始查询	`LOC131023021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=31.2; qcov=0.326; evalue=1.29e-31; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.8; qcov=0.98; evalue=1.46e-73; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808540.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808540.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808540.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808540.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12793280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B132,B95,C22,C57
`Chr4:12793284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr4:12793294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:12793305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr4:12793373`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C68
`Chr4:12793373`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C68
`Chr4:12793374`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A1,A6,B114,B46,C10,C12,C17,C26,C41,C64,D7
`Chr4:12793392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:12793406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:12793430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr4:12793504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C29
`Chr4:12793517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A19,A3,A4,A8,B104,B118,B12,B126,B136,B17,B24,B35,B38,B39,B41,B51,B52,B53,B62,B8,B80,C27,C3,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808540.1

847 aa

424

847

RVT_1

PF00078 RVT_1 382-605 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808540.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	382	605	5.1e-21	76.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952557.1
ATGTGTTCTAACATTTGGATTTTTACTCAACCTGATGTTCGTACGAATTTGATTTTTGCTTCTGATCAAGTGGTTATTGTTGACTGTGACTGGCAGAGCAAGAACTTTCGTGTGGCTGTTGTTCATGGCGCTTCTACTTACTTGTTAAGACGTGAGCTTTGGATTGACATTCTGAATCATGCTGTGAACAATTTTGTGGTTTTGGGAGATTTTAATGCCGTCAAGGGTGCTCATGAAAGGAGCAGCAACTGTAGGCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023021
ATGTGTTCTAACATTTGGATTTTTACTCAACCTGATGTTCGTACGAATTTGATTTTTGCTTCTGATCAAGTGGTTATTGTTGACTGTGACTGGCAGAGCAAGAACTTTCGTGTGGCTGTTGTTCATGGCGCTTCTACTTACTTGTTAAGACGTGAGCTTTGGATTGACATTCTGAATCATGCTGTGAACAATTTTGTGGTTTTGGGAGATTTTAATGCCGTCAAGGGTGCTCATGAAAGGAGCAGCAACTGTAGGCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808540.1
MCSNIWIFTQPDVRTNLIFASDQVVIVDCDWQSKNFRVAVVHGASTYLLRRELWIDILNHAVNNFVVLGDFNAVKGAHERSSNCRPNITSCEEFGAFINALGCIESPVIGLKYTWSGRRFMPSHVESKLDRAFYSDSFANSWHTVFSQILPRNTSDHSPLVLRCQSTLPSSRKFFRFLNMWTLHPGFLDLVKASWSTPVDNSCPIYTVMIKLKRLRTEIRNWNKSTFGNVDLMIMEKQQDLSEIQEKIAVEGYTEDLFDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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