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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002053`

染色体: Chr01 坐标: 36325225-36326087 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002053`
名称	SmilChr01G002053
描述	EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 9
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36325225 - 36326087 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023025`
GeneID	`131023025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023025`
原始查询	`LOC131023025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 9
产物	EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 9
Arabidopsis	`AT4G12970` (STOMAGEN) stomagen [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826909] identity=78; qcov=0.602; evalue=7.45e-31; confidence=medium
Rice	`Os01g0914400` (STOMAGEN) - identity=84; qcov=0.51; evalue=5.52e-28; confidence=medium
GO	GO:2000123 (positive regulation of stomatal complex development)
KEGG	-
Pfam	PF16851 (Stomagen)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057808547.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808547.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808547.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808547.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36325421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr1:36325811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:36325827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808547.1

103 aa

103

Stomagen

PF16851 Stomagen 54-102 aa

XP_057808551.1

98 aa

Stomagen

PF16851 Stomagen 49-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808547.1`	Pfam	`PF16851`	Stomagen	Domain	54	102	1e-32	112.6	Stomagen
`XP_057808551.1`	Pfam	`PF16851`	Stomagen	Domain	49	97	9.1e-33	112.7	Stomagen

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952568.1
GATTTTGTAGGTCTCTGGAAATGGAATGATCCAGCAATTTGTTATTTGAAAATGTAGTTTTGTCTGTTTTTGTCTTTGCAGTAGTACTACTACATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTTATGGTCAGTATTCATTCATATTTACATTCTTCACATCCTTTCTCTTCTCCAAACACTTTACCACTACGATTATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCC...

XM_057952564.1
GTAGGTCTCTGGAAATGGAATGATCCAGCAATTTGTTATTTGAAAATGTAGTTTTGTCTGTTTTTGTCTTTGCAGTAGTACTACTACATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTTATGGTCAGTATTCATTCATATTTACATTCTTCACATCCTTTCTCTTCTCCAAACACTTTACCACTACGATTATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCCACAGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023025
ATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCCACAGGGTCCAGAGTTCAAATGGCACATCTCAGAAACTGGAAAGATGACCATATTCCATCAGCAGAGAGAGAATTGTGGGAAATGCAGCAAAGTTCTAGAAGGTTCTTGATCGGCTCAGTAGCTCCGACGTGTACCTACAACGAATGCAGAGGTTGCCGATTTAAGTGCAGAGCAGAGCAAGTTCCTGTTGAAGG...

LOC131023025
ATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCCACAGGGTCCAGAGTTCAAATGGCACATCTCAGAAACTGGAAAGATGACCATATTCCATCAGCAGAGAGAGAACAAAGTTCTAGAAGGTTCTTGATCGGCTCAGTAGCTCCGACGTGTACCTACAACGAATGCAGAGGTTGCCGATTTAAGTGCAGAGCAGAGCAAGTTCCTGTTGAAGGCAATGATCCTATAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808547.1
MEKRLLLLGLLCAALLLLVQDATGSRVQMAHLRNWKDDHIPSAERELWEMQQSSRRFLIGSVAPTCTYNECRGCRFKCRAEQVPVEGNDPINSAYHYKCVCHR

XP_057808551.1
MEKRLLLLGLLCAALLLLVQDATGSRVQMAHLRNWKDDHIPSAEREQSSRRFLIGSVAPTCTYNECRGCRFKCRAEQVPVEGNDPINSAYHYKCVCHR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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