当前解析结果
SmilChr04G000973| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000973 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000973 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000973 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 13046546 - 13048048 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023027 |
|---|---|
| GeneID | 131023027 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023027 |
| 原始查询 | LOC131023027 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G05850 (MUG7)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.4; qcov=0.717; evalue=2.53e-09; confidence=low |
| Rice | Os12g0597300- identity=29.3; qcov=0.846; evalue=4.99e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023027 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808546.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808546.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808546.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808546.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808546.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:13046556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr4:13047211 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr4:13047225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C14,C23,C65 |
Chr4:13047250 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 60 | A13,A8,B1,B10,B107,B110,B122,B128,B13,B130,B139,B15,B17,B2,B20,B21,B22,B30,B48,B49,B52,B57,B60,B61,B64,B68,B71,B72,B79,B8,B84,B90,B92,B98,B99,C13,C18,C27,C29,C31,C32,C35,C48,C49,C5,C53,C55,C59,C6,C60,C61,C68,C71,C76,C83,C86,C87,D10,D4,D7 |
Chr4:13047253 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B137,B40,B58,B80,C23,C54,C64 |
Chr4:13047261 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:13047265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B109,B114,C41 |
Chr4:13047265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B114,C41 |
Chr4:13047270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B79 |
Chr4:13047272 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:13047291 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr4:13047292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B44,B67,C19,C25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。