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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001042`

染色体: Chr04 坐标: 14841519-14842618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001042`
名称	SmilChr04G001042
描述	uncharacterized SmilChr04G001042
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	14841519 - 14842618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023047`
GeneID	`131023047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023047`
原始查询	`LOC131023047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.1; qcov=0.946; evalue=3.65e-39; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=31.3; qcov=0.927; evalue=6.6e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808572.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808572.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808572.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808572.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:14841525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A3,B112
`Chr4:14841525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B112
`Chr4:14841538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B140,B65
`Chr4:14841555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr4:14841558`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr4:14841558`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr4:14841584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:14841598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C18
`Chr4:14841599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:14841606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B53,B79
`Chr4:14841622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B13,C42,C76
`Chr4:14841626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808572.1

331 aa

166

331

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 174-266 aa PF00872 Transposase_mut 191-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808572.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	174	266	4.9e-18	66.0	MULE transposase domain
`XP_057808572.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	191	281	6.3e-08	32.6	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952589.1
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGGACGCTCAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCAATCTGATAAGTGCAAGTTCGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGCGGAGGGATGTGGGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGGGGAATTGGGCATTTTGAAACGAATAAAGGTACACTCGAATGTGGTTGCAGCTTATGTGGAAAAAAGAATACGTGATGATGGAGAGGTCATTAAGCCGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023047
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGGACGCTCAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCAATCTGATAAGTGCAAGTTCGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGCGGAGGGATGTGGGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGGGGAATTGGGCATTTTGAAACGAATAAAGGTACACTCGAATGTGGTTGCAGCTTATGTGGAAAAAAGAATACGTGATGATGGAGAGGTCATTAAGCCGAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808572.1
MKQGAEAKVGRSDQGRLYYKCKQSDKCKFDVRASCHGGGMWGVHKFKEHSCQGELGILKRIKVHSNVVAAYVEKRIRDDGEVIKPKSIMAELLHEFGVRIKYDVALRARNLSLEKIYGRIDDSFLLLPKYLYALRQANPGTLTGLEVDENNWFKHLFVALAASTSPFFFSLRPVIVLDGTHLKGKNNGILFVAVTKDGNEQVFPLAFGVGPIENDESWKWFLSHVRQTFGQPDNLLVVSDAHVSIANAVKSELPNATHGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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