当前解析结果
SmilChr04G001061| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001061 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001061 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001061 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 15183891 - 15184523 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023055 |
|---|---|
| GeneID | 131023055 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023055 |
| 原始查询 | LOC131023055 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023055 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808580.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808580.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057808580.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808580.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808580.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:15183909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 56 | A13,A18,A2,A21,A25,A7,A8,B1,B10,B107,B112,B118,B119,B120,B123,B124,B13,B132,B136,B14,B140,B16,B24,B25,B38,B39,B46,B47,B62,B68,B70,B71,B73,B75,B79,B8,B87,B91,B99,C13,C21,C32,C39,C47,C48,C53,C59,C61,C65,C68,C75,C78,C84,C86,C87,D9 |
Chr4:15183914 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B35,B7,D3 |
Chr4:15183919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B38,B39 |
Chr4:15183925 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr4:15183926 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr4:15183941 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr4:15183950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B128,B92,D9 |
Chr4:15184051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,B66 |
Chr4:15184057 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr4:15184067 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B71,B77 |
Chr4:15184088 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 103 | A10,A11,A2,A20,A24,A5,A6,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B110,B121,B127,B13,B130,B131,B134,B135,B138,B139,B14,B15,B17,B22,B26,B28,B29,B33,B36,B38,B39,B4,B40,B45,B47,B48,B49,B52,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B64,B65,B68,B72,B74,B76,B77,B85,B88,B9,B90,B92,B94,B96,C1,C10,C12,C15,C18,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C29,C31,C33,C37,C38,C4,C40,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C60,C61,C63,C64,C66,C70,C71,C73,C74,C77,C80,C86,C87,D1,D11,D4 |
Chr4:15184101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。