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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001077`

染色体: Chr04 坐标: 15457140-15458507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001077`
名称	SmilChr04G001077
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15457140 - 15458507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023058`
GeneID	`131023058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023058`
原始查询	`LOC131023058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=34.2; qcov=0.919; evalue=3.52e-79; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=45; qcov=0.864; evalue=1.59e-118; confidence=high
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808583.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808583.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808583.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808583.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15457162`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A13,B114,B12,B99,C37,C43,C54,C67
`Chr4:15457181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B26,B66,D7
`Chr4:15457248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C16,C62,D3
`Chr4:15457260`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B104,B26,B39,C64,C68
`Chr4:15457260`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B104,B26,B39,C64,C68
`Chr4:15457270`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A1,A2,A24,A5,B105,B119,B122,B13,B14,B40,B47,B58,B59,B65,B70,B89,B97,C14,C42,C6,D10
`Chr4:15457293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A11,A13,A16,A23,A25,A4,A6,B10,B100,B107,B109,B11,B114,B117,B12,B132,B135,B139,B2,B22,B25,B28,B29,B41,B5,B51,B52,B55,B65,B66,B67,B73,B90,B93,B98,B99,C12,C13,C17,C19,C2,C29,C3,C30,C34,C37,C39,C43,C44,C45,C47,C50,C52,C54,C56,C62,C63,C66,C67,C69,C7,C70,C73,C81,C83,C84,C86,C87,D11
`Chr4:15457305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B21,B42,B43,B76,B95,C39,C50
`Chr4:15457310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15457344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:15457415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:15457432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808583.1

455 aa

228

455

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 264-358 aa PF00872 Transposase_mut 278-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808583.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	264	358	3e-27	95.5	MULE transposase domain
`XP_057808583.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	278	440	7.8e-06	25.7	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952600.1
ATGACGAGTACAGAAGAAGCTATCCGTGAGTTATTTGGAAACGAGGAGGATGAAACATCATTCGTGAGTGAAGAATCTGATGACAACGAGGAGAATGTGAACTCCGACGAAATGCGTGATGCAAGAACGGAAGAAGCTTTTGAGGTGATGGTGCGAGATGGACCTCAAATGGGAATGTTGTTCGAATCTAAAGAACAACTATACGAAGCTTATAATTCATACGCAAAGGTAAAAGGATTCAACATCTTTAGTAGAAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023058
ATGACGAGTACAGAAGAAGCTATCCGTGAGTTATTTGGAAACGAGGAGGATGAAACATCATTCGTGAGTGAAGAATCTGATGACAACGAGGAGAATGTGAACTCCGACGAAATGCGTGATGCAAGAACGGAAGAAGCTTTTGAGGTGATGGTGCGAGATGGACCTCAAATGGGAATGTTGTTCGAATCTAAAGAACAACTATACGAAGCTTATAATTCATACGCAAAGGTAAAAGGATTCAACATCTTTAGTAGAAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808583.1
MTSTEEAIRELFGNEEDETSFVSEESDDNEENVNSDEMRDARTEEAFEVMVRDGPQMGMLFESKEQLYEAYNSYAKVKGFNIFSRNTSSNGNYCRMTCDRGGKVCSKKYTKKTNCLAHINAIRQPTGFWMVSSVCIEHNHDLDMSMSAFMPGHRHLTLGLKRQLEANDRACIRICKNVKLMEVLAGGPENIGATTKDCRNFIDKRRRLRLGEGDAEAISQLFSRLQKSDARFFHLMDIDDHGRLRNVMWIHPRSIAAYEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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