当前解析结果
SmilChr04G001127| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001127 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001127 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001127 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 16329986 - 16330375 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023072 |
|---|---|
| GeneID | 131023072 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023072 |
| 原始查询 | LOC131023072 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os08g0315200- identity=32.8; qcov=0.969; evalue=4.43e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023072 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808597.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057808597.1 |
| 3 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057808597.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808597.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808597.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:16329998 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 16 | B107,B127,B137,B26,B56,B64,B66,B79,B85,C13,C26,C4,C68,C8,C87,D4 |
Chr4:16330009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B25 |
Chr4:16330044 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr4:16330126 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B76,C44,C6 |
Chr4:16330165 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B82,C14,C9 |
Chr4:16330171 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr4:16330231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr4:16330259 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B62,B64,C14,C41,C65 |
Chr4:16330284 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B94 |
Chr4:16330284 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr4:16330300 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A11,C64 |
Chr4:16330300 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A11,C64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。