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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001151`

染色体: Chr04 坐标: 16976740-16977351 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001151`
名称	SmilChr04G001151
描述	uncharacterized SmilChr04G001151
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	16976740 - 16977351 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023083`
GeneID	`131023083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023083`
原始查询	`LOC131023083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.6; qcov=0.721; evalue=7.99e-10; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=30.5; qcov=0.916; evalue=4.35e-16; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808609.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808609.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808609.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808609.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:16976770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:16976795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B1,B24
`Chr4:16976893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:16976912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:16976952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:16976973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,C36,C61,D1
`Chr4:16976980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr4:16977185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B3,C36,C61,D1
`Chr4:16977197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr4:16977197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:16977198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	170	A1,A10,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B108,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B134,B136,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B33,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B50,B51,B54,B55,B58,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B94,B97,B98,C11,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C35,C36,C38,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C69,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C81,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7
`Chr4:16977221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808609.1

179 aa

179

SWIM

PF04434 SWIM 66-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808609.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	66	95	2e-06	27.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952626.1
ATGTTGGAGGCAATCAGATTAGTTATCGAGCGGTGGTTCAACGACAGGCTTGCGGCTACACAAGAGAGCGACGAACATTTGACTCCGGAGGTAAAACAGAAGCTCAGTGCAGAACTTATAAAAAGTCGTCGTTACACAGCCAAGGGGACCACCGAGAGAAAATACAGGATTCGTGCTAGTGGTCGCTATTATATGGTTGACCTTCAAAAGAAGAGATGTGAATGCAACGAATTCGACCTGGACCAGATGCCGTGTTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023083
ATGTTGGAGGCAATCAGATTAGTTATCGAGCGGTGGTTCAACGACAGGCTTGCGGCTACACAAGAGAGCGACGAACATTTGACTCCGGAGGTAAAACAGAAGCTCAGTGCAGAACTTATAAAAAGTCGTCGTTACACAGCCAAGGGGACCACCGAGAGAAAATACAGGATTCGTGCTAGTGGTCGCTATTATATGGTTGACCTTCAAAAGAAGAGATGTGAATGCAACGAATTCGACCTGGACCAGATGCCGTGTTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808609.1
MLEAIRLVIERWFNDRLAATQESDEHLTPEVKQKLSAELIKSRRYTAKGTTERKYRIRASGRYYMVDLQKKRCECNEFDLDQMPCSHAIAAITEANESVEDYVHSYYWRSSLVDTYSGDVNHLPPIENWNIPFEIASELVLPNLSQRQAGRPRKTRVRSACERPTQSTSTAGASSSRKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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