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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001170`

染色体: Chr04 坐标: 17505225-17511219 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001170`
名称	SmilChr04G001170
描述	uncharacterized SmilChr04G001170
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	17505225 - 17511219 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023089`
GeneID	`131023089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023089`
原始查询	`LOC131023089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal protein S5 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829965]; symbol=AT4G38090; hit=AT4G38090; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ribosomal protein S5 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829965]; symbol=AT4G38090; hit=AT4G38090; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G38090` (AT4G38090) ribosomal protein S5 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829965] identity=62.4; qcov=0.595; evalue=1.93e-70; confidence=medium
Rice	`Os08g0478100` - identity=64.1; qcov=0.559; evalue=4.98e-68; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006446 (regulation of translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01205 (Impact_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808615.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808615.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808615.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808615.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:17505273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C38,C5,C63,C71,C86
`Chr4:17506096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C13,C46
`Chr4:17506550`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,B122,B63,B68,C42,C86,D5
`Chr4:17506551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A15,B31,B40,B76,B77,C21,C38,C74,C79
`Chr4:17506585`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A11,B122,B63,B68,C42,C86,D5
`Chr4:17506809`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	192	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A19,A2,A21,A22,A25,A4,A6,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B62,B67,B69,B70,B71,B72,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C42,C43,C44,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D9
`Chr4:17506822`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A4,B102,B4,B41,B5,B77,B92,B93,C23,C26,C54,C81,C84
`Chr4:17506965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	75	A1,A10,A13,A14,A15,A19,A23,A24,A25,A6,B100,B104,B110,B112,B119,B125,B126,B132,B133,B136,B138,B15,B21,B23,B24,B3,B31,B34,B42,B43,B46,B47,B5,B50,B55,B56,B59,B61,B63,B64,B65,B7,B71,B76,B80,B83,B86,B9,B93,B95,B96,C16,C17,C19,C2,C21,C36,C40,C45,C47,C5,C54,C56,C65,C7,C72,C73,C74,C77,C78,C8,C85,C86,D3,D7
`Chr4:17506984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B131
`Chr4:17506985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B41,B73,B89,C3
`Chr4:17507065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B122,B127,B59,C5
`Chr4:17507394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808615.1

299 aa

150

299

Impact_N

PF01205 Impact_N 74-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808615.1`	Pfam	`PF01205`	Impact_N	Domain	74	174	1.5e-33	115.7	Impact N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952632.1
ATGCCAGAGCAGCGGAATGGGATGCCAGAGAAATCCAAGCTCCCGAGCAGCGAAATAACCATTCCTCTGAAAAAGCGCCAGAGGAATCGGAAATCACATGCCGCTGCCGCTCACTTGTCACCTCTTCATTTTTACAACTCCACGCACCAAGGCCAAAGGTTTGTCAATGCTCTCCGCTTCTTCACGCTCAAAGAGAGAGTCTCTTTCGATAAAGAAATCAAGAAAAGCAAATTCATCGCCATTGCTGCCCCTATCTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023089
ATGCCAGAGCAGCGGAATGGGATGCCAGAGAAATCCAAGCTCCCGAGCAGCGAAATAACCATTCCTCTGAAAAAGCGCCAGAGGAATCGGAAATCACATGCCGCTGCCGCTCACTTGTCACCTCTTCATTTTTACAACTCCACGCACCAAGGCCAAAGGTTTGTCAATGCTCTCCGCTTCTTCACGCTCAAAGAGAGAGTCTCTTTCGATAAAGAAATCAAGAAAAGCAAATTCATCGCCATTGCTGCCCCTATCTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808615.1
MPEQRNGMPEKSKLPSSEITIPLKKRQRNRKSHAAAAHLSPLHFYNSTHQGQRFVNALRFFTLKERVSFDKEIKKSKFIAIAAPISDERSTFSFIAEVREPRATHNCWAYKIGDQFRSNDDGEPSGTVGKPIQSAIESSGIDRVMVVVIRYFGGIKLGTGGLVRAYRGVAAECLRNAPTCLVKSKVIKFPKFSFLCYFSQSIAFDNAFMLAPVGLHVTFDLLGVLYIKINKSCIIPKNIRILKNNKQSGLDVELDAKGDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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