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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001193`

染色体: Chr04 坐标: 18249630-18253352 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001193`
名称	SmilChr04G001193
描述	uncharacterized SmilChr04G001193
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	18249630 - 18253352 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023098`
GeneID	`131023098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023098`
原始查询	`LOC131023098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0627900` - identity=48.6; qcov=0.781; evalue=1.98e-69; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808625.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808625.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057808625.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808625.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:18249631`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A2,B110,B13,B33,B38,B39,B55,B70,B78,B82,C12,C31,C75,C78,D1
`Chr4:18249633`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A2,B110,B13,B33,B38,B39,B55,B70,B78,B82,C12,C31,C75,C78,D1
`Chr4:18249641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A8,B126,B135,B16,B33,B50,B76,B99,C15,C27,C31,C45,C83,D10,D11
`Chr4:18249645`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:18249645`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:18249649`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B35,C67
`Chr4:18249649`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B35,C67
`Chr4:18249660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C60,D5
`Chr4:18249662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,D4
`Chr4:18249677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B134,C6,C72
`Chr4:18249684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A16,A20,A21,A4,A8,B104,B105,B112,B12,B128,B129,B130,B133,B140,B22,B29,B31,B39,B42,B45,B51,B59,B60,B80,B84,C10,C14,C19,C21,C23,C25,C29,C3,C30,C31,C37,C47,C49,C50,C52,C9
`Chr4:18249714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C13,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808625.1

274 aa

137

274

zf-CCHC

SH3_Tf2-1

PF00098 zf-CCHC 20-37 aa PF24626 SH3_Tf2-1 135-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808625.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	20	37	1.9e-05	25.3	Zinc knuckle
`XP_057808625.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	135	200	3.3e-24	85.5	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952642.1
ATGCCGCCGTGTGCCAAGTGCAACAAGATGCACTTGAGGGTTTGCAAAGCTGGATCTAATGTTTGCTACAACTGTGGACAAGCTGGTCATTACTCGTCGCACTGCCCGAGTAAACAACAAGGAATGGCAAGAGGGAAGCCTGATCAGAGTTCGGCTCAGCCCTTGAGAGCCATTATGGGTTACCAGGCGACTATTGGTATGGCTCCGTATGAAGCTCTTTACGGAAAGAAATGTAGATCACCACTTTACTGGGATGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023098
ATGCCGCCGTGTGCCAAGTGCAACAAGATGCACTTGAGGGTTTGCAAAGCTGGATCTAATGTTTGCTACAACTGTGGACAAGCTGGTCATTACTCGTCGCACTGCCCGAGTAAACAACAAGGAATGGCAAGAGGGAAGCCTGATCAGAGTTCGGCTCAGCCCTTGAGAGCCATTATGGGTTACCAGGCGACTATTGGTATGGCTCCGTATGAAGCTCTTTACGGAAAGAAATGTAGATCACCACTTTACTGGGATGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808625.1
MPPCAKCNKMHLRVCKAGSNVCYNCGQAGHYSSHCPSKQQGMARGKPDQSSAQPLRAIMGYQATIGMAPYEALYGKKCRSPLYWDEVGERKVLGPDTVAEMIEIVRKIRQRIKEAQDRQKSYADTRRTELHFEIGDKVFFKVSPSKGINRFGVKGKLRPRFIDPYEILEKIGPVACRLALPPSFGNVHNVFHVSQLRRYVFDPKHVVYQEEMVLEPDLSYEESPEIILDRKIQQLRSKSIALVKVQWRHHGYEEATWELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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