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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001222`

染色体: Chr04 坐标: 19073603-19077993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001222`
名称	SmilChr04G001222
描述	DNA repair RAD52-like protein 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19073603 - 19077993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023108`
GeneID	`131023108`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023108`
原始查询	`LOC131023108`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair RAD52-like protein 1, mitochondrial
产物	DNA repair RAD52-like protein 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G71310` (RAD52-1) cobalt ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843472] identity=66.7; qcov=0.56; evalue=3.41e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0851500` (OsRad52-2a) - identity=47.4; qcov=0.507; evalue=1.01e-17; confidence=low
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023108

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808635.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057808635.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808635.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808635.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19073610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C23
`Chr4:19073611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B58
`Chr4:19073638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C37
`Chr4:19073650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:19073651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B56,B86,C4
`Chr4:19073663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:19073678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B112,B53
`Chr4:19073702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C62,C70
`Chr4:19073703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:19073712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C2,C67,C86
`Chr4:19073720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C14,C2,C79
`Chr4:19073722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952652.1
ATGGCTGCCGTGGTCGCCAAAAATCGCAAAGAGGCGGTGAGGGTTTCGGGATCTAGGGGCGCGGCGATTCGCGCCGAAAATCACAAAGAGCCGGAAATTGCAAAGAGGCGCCCTTCGCCGGACCTCGAATCAGAAGGTGGAACTGTGGAAGGGGCAGATCTCATCGCTGCGAATCGCGGTGGAATGCGGCCGATACATTCCCTGGCACATACTGAATGGTCTAGTGAGGTCCGTAGCATCACTTATTCTAGAGATGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023108
ATGGCTGCCGTGGTCGCCAAAAATCGCAAAGAGGCGGTGAGGGTTTCGGGATCTAGGGGCGCGGCGATTCGCGCCGAAAATCACAAAGAGCCGGAAATTGCAAAGAGGCGCCCTTCGCCGGACCTCGAATCAGAAGGTGGAACTGTGGAAGGGGCAGATCTCATCGCTGCGAATCGCGGTGGAATGCGGCCGATACATTCCCTGGCACATACTGAATGGTCTAGTGAGGTCCGTAGCATCACTTATTCTAGAGATGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808635.1
MAAVVAKNRKEAVRVSGSRGAAIRAENHKEPEIAKRRPSPDLESEGGTVEGADLIAANRGGMRPIHSLAHTEWSSEVRSITYSRDATSVPIAYRVTLYGSDAEIFREATGNASVSDTSYGGPVQKAEAMAFHGAYARLGLGLHLYHQDLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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