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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001234`

染色体: Chr04 坐标: 19355642-19357036 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001234`
名称	SmilChr04G001234
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19355642 - 19357036 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023111`
GeneID	`131023111`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023111`
原始查询	`LOC131023111`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32.1; qcov=0.838; evalue=1.14e-60; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=37.3; qcov=0.897; evalue=7.99e-88; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023111

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808637.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808637.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808637.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808637.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19355673`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	15	A10,A14,B2,B34,B52,B90,B93,C30,C31,C45,C46,C53,C54,C69,C76
`Chr4:19355720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:19355810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B73
`Chr4:19355813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A5,B38
`Chr4:19355816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B38
`Chr4:19355822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C78,D5
`Chr4:19355864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B75,C78,D5
`Chr4:19356048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B19
`Chr4:19356049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr4:19356081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:19356092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:19356159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B112,B53,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808637.1

464 aa

232

464

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 103-193 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 285-398 aa PF10551 MULE 315-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808637.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	193	1.4e-14	55.3	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057808637.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	285	398	2e-09	38.2	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057808637.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	315	409	1.8e-29	102.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952654.1
ATGGATTTTAATTTGAATGAGTATCCATCTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGCCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGATGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023111
ATGGATTTTAATTTGAATGAGTATCCATCTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGCCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGATGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808637.1
MDFNLNEYPSNDVGDEDEVLSRKEAFVDENNVENRNEDCDDNSDVGDGDKDQSLEEVEENVEDEQHDEHDCANFVDLLNRIDVLEMVLEVGKSVNDPEEAHILYCEYARLKGFSVTRDNKGYFNHTKICSFQTFLCCCHGKSETKTSLDRGMATYKKQDRKTMCKAKLRVSRRRNQPWKVSSWYREHNHELFPSDQSYLLRSARSLSKCKKLLIEAMNSAGIGISRACAFIEKESGWPQNCGFTRKDAYNHINGIKMKTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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