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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001241`

染色体: Chr04 坐标: 19508757-19509506 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001241`
名称	SmilChr04G001241
描述	uncharacterized SmilChr04G001241
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19508757 - 19509506 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023114`
GeneID	`131023114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023114`
原始查询	`LOC131023114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=31.2; qcov=0.514; evalue=7.38e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.5; qcov=0.831; evalue=5.63e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808641.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808641.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808641.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808641.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19508765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B54,C69
`Chr4:19508795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B74
`Chr4:19508828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,B91,C49,D3
`Chr4:19508841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:19508869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C81,C82
`Chr4:19508875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C48
`Chr4:19508880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B4,C19,C71
`Chr4:19508881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B91,D3
`Chr4:19508887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:19508918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:19508923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr4:19509056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C10,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808641.1

249 aa

124

249

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808641.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	150	4e-18	66.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952658.1
ATGGGAGAGTGGATCGGGGGAGAATGGAGGTGGAAGCTCAGCTGGAATAGAGTTTTGAGGGATAGGGAGCAGGAACAAGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTTCAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGACTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAACACTGGAAGGAAGGAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023114
ATGGGAGAGTGGATCGGGGGAGAATGGAGGTGGAAGCTCAGCTGGAATAGAGTTTTGAGGGATAGGGAGCAGGAACAAGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTTCAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGACTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAACACTGGAAGGAAGGAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808641.1
MGEWIGGEWRWKLSWNRVLRDREQEQVHRLSDLLSNYCLSAGKSDVWKWKATSDFTFSVKSAYKAICLMANPTNTGRKEKEMLTIWKAPAPLKAVTTSWKLFKGRLPTCDNLLKRQVPIQNSEALCVRCKLKEETIEHTFFACQNSDDIWKKIIFWLGQQSVLHRKVKDHYNAFTNLGKKENQRFLRGVWICTTWVLWKERNECKFNQGKWNGEKLFAEIKSRLWGWKMTYKMSSSTSDFRNWFLAAFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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