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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001244`

染色体: Chr04 坐标: 19574648-19577089 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001244`
名称	SmilChr04G001244
描述	uncharacterized SmilChr04G001244
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19574648 - 19577089 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023117`
GeneID	`131023117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023117`
原始查询	`LOC131023117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808643.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808643.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808643.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808643.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19574683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A11,A15,A19,A2,A20,A24,A5,A6,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B119,B12,B121,B127,B13,B130,B133,B134,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B24,B26,B29,B32,B33,B38,B39,B40,B45,B47,B50,B52,B56,B57,B6,B64,B85,B86,B88,B9,B94,B96,C1,C10,C12,C14,C22,C24,C25,C33,C34,C37,C38,C4,C40,C49,C51,C54,C56,C57,C60,C63,C64,C66,C70,C73,C74,C77,C86,D1,D2
`Chr4:19574706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79
`Chr4:19574822`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,B137
`Chr4:19574822`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B102,B137
`Chr4:19575994`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	78	A11,A15,A19,A2,A20,A24,A5,A6,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B119,B12,B121,B13,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B24,B26,B29,B32,B33,B38,B39,B45,B47,B50,B52,B56,B57,B64,B68,B85,B86,B88,B9,B94,B96,C1,C10,C12,C14,C22,C24,C25,C33,C34,C37,C38,C4,C40,C49,C51,C54,C56,C57,C60,C63,C64,C66,C70,C73,C74,C8,C86,D1,D2
`Chr4:19575995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B99,C80,C81,C82
`Chr4:19575999`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A11,A15,A19,A2,A20,A24,A5,A6,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B119,B12,B121,B13,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B24,B26,B29,B32,B33,B38,B39,B45,B47,B50,B52,B56,B57,B64,B68,B85,B86,B88,B9,B94,B96,C1,C10,C12,C14,C22,C24,C25,C33,C34,C37,C38,C4,C40,C49,C51,C54,C56,C57,C60,C63,C64,C66,C70,C73,C74,C8,C86,D1,D2
`Chr4:19576028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4
`Chr4:19576100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:19576119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B12,B99,C83,C9
`Chr4:19576144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:19576194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808643.1

237 aa

118

237

DUF8803

PF31073 DUF8803 145-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808643.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	145	177	9.4e-09	35.7	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952660.1
ATGGCCAGCGCGGTAGAACAGACGTGGAATGATGAGATCATATTGCTCTGCGATACCAGAGAGATGGGGACTTCACAGGTGGAGCTAGCAAATAGATCAATCTGCGAGGGGATCAAAAAGCGGCTGAATCAGAGCAGAGGGAAATGGATCGAGGAGTTAGACACTGTCCTTTGGGCCTACCGAACTAGCCCAAATACAGCAATCGGAGAGGCGCCTTTCACCCTGGTATACGGGTCCAATGCAGTAATACCAGTGGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023117
ATGGCCAGCGCGGTAGAACAGACGTGGAATGATGAGATCATATTGCTCTGCGATACCAGAGAGATGGGGACTTCACAGGTGGAGCTAGCAAATAGATCAATCTGCGAGGGGATCAAAAAGCGGCTGAATCAGAGCAGAGGGAAATGGATCGAGGAGTTAGACACTGTCCTTTGGGCCTACCGAACTAGCCCAAATACAGCAATCGGAGAGGCGCCTTTCACCCTGGTATACGGGTCCAATGCAGTAATACCAGTGGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808643.1
MASAVEQTWNDEIILLCDTREMGTSQVELANRSICEGIKKRLNQSRGKWIEELDTVLWAYRTSPNTAIGEAPFTLVYGSNAVIPVEARLESYRITTYDTEQNSELRRTELDLVEAQREEAQVRAAKYKSIIKAGYDKRVRARKLAKGDLVLKRSNALKPVGKFEPNWEGPFIITESVPTKQEEKQRGEAAKESSKWSSEGMIQKEESEKSSKQDSEKFPNEESEQSQKEESERYPEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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