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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001276`

染色体: Chr04 坐标: 20291695-20292501 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001276`
名称	SmilChr04G001276
描述	uncharacterized SmilChr04G001276
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	20291695 - 20292501 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023124`
GeneID	`131023124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023124`
原始查询	`LOC131023124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=24.8; qcov=0.502; evalue=2.47e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808649.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808649.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808649.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808649.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:20291697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:20291703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:20291716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr4:20291725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A22,B121,B70,B81,B94,C50,C65
`Chr4:20291734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B120,B139,B62,B98,C18,C22,C44
`Chr4:20291739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:20291742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B73,C68
`Chr4:20291760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C17,C47
`Chr4:20291763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr4:20291791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C18,C2,C35
`Chr4:20291791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:20291817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B28,B98,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808649.1

249 aa

124

249

Ty3_capsid

PF19259 Ty3_capsid 88-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808649.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	88	214	4e-15	56.5	Ty3 transposon capsid-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952666.1
ATGGAAGGGAAAATCGAGAGCCTGGAGGCACAGATTGGTCAAATCAGGCAGCAACAGACAGAATTGGGCCAATCATTAATGGCAGTTTTCAAAAAGCAGTTTGAAGAATTGAGAAAAGAATTGAGGACAGAGGGCAAACGAGCAGAAGCAAAAGAAATGGAGATGATTCATCATCTTCTCAATCTAGAGAGGAACACAATCAAGGTGATCAACCTAGACAGTGGATTAGGAAGTGTGAAAAGTACTTCATGTTTAATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023124
ATGGAAGGGAAAATCGAGAGCCTGGAGGCACAGATTGGTCAAATCAGGCAGCAACAGACAGAATTGGGCCAATCATTAATGGCAGTTTTCAAAAAGCAGTTTGAAGAATTGAGAAAAGAATTGAGGACAGAGGGCAAACGAGCAGAAGCAAAAGAAATGGAGATGATTCATCATCTTCTCAATCTAGAGAGGAACACAATCAAGGTGATCAACCTAGACAGTGGATTAGGAAGTGTGAAAAGTACTTCATGTTTAATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808649.1
MEGKIESLEAQIGQIRQQQTELGQSLMAVFKKQFEELRKELRTEGKRAEAKEMEMIHHLLNLERNTIKVINLDSGLGSVKSTSCLIPMSDTDKILTAAMHIEGQADVWYLEYVEGKDDLTWEGFKELVLDRFSNIEEKNLVAQFNKLKQETDVLSYTLKFEALKAFTVSNNRGLSEEYFVQSYISGLKDEIARMIEMFNLTTYKSAVQLAKKQELLIGSLGRGSKHFSKIGGNSFDSGWKKSHEEVGGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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