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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001345`

染色体: Chr04 坐标: 21811613-21814312 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001345`
名称	SmilChr04G001345
描述	uncharacterized SmilChr04G001345
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21811613 - 21814312 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023145`
GeneID	`131023145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023145`
原始查询	`LOC131023145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0768600` - identity=35.6; qcov=0.462; evalue=6.03e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808676.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808676.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808676.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808676.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21811753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:21812407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:21812820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr4:21812866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C38
`Chr4:21812927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B127,B78,B79
`Chr4:21813058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B29,C13
`Chr4:21813181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:21813234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B119,B129,B91,C43
`Chr4:21813235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B4,B97
`Chr4:21813267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B104
`Chr4:21813312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B118,B127,B78,C68
`Chr4:21813408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808676.1

730 aa

365

730

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 57-170 aa PF13952 DUF4216 337-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808676.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	57	170	9.6e-43	145.4	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057808676.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	337	409	5.1e-19	69.3	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952693.1
TGAAAAGAAAATCTTACTTCAATGGATCAAGAGTCTTAAGTTTCCCGATGGGTACATGTCAAATATTAGCAGATGCGTTGATTTGAACGCTCTGAAGATGCATAACATGAAAAGCCACGACTGTCACGTGTTCATGCAATTACTACTACCTGTAGCCTTTAAAGAACTTCTTCCTAAGAATGTTTGGGAGGCAATTACAGAGTTAAGTTGTTTCTTTAGAGAATTAACAGCCCGCAATATCTCAATACATGATATGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023145
ATGTCAAATATTAGCAGATGCGTTGATTTGAACGCTCTGAAGATGCATAACATGAAAAGCCACGACTGTCACGTGTTCATGCAATTACTACTACCTGTAGCCTTTAAAGAACTTCTTCCTAAGAATGTTTGGGAGGCAATTACAGAGTTAAGTTGTTTCTTTAGAGAATTAACAGCCCGCAATATCTCAATACATGATATGGGAATACTCAATGAGAAGATATCAGTTACTCTATGCAAACTTGAGCGTATCTTCCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808676.1
MSNISRCVDLNALKMHNMKSHDCHVFMQLLLPVAFKELLPKNVWEAITELSCFFRELTARNISIHDMGILNEKISVTLCKLERIFPPSFFDSMEHLPVHLADEARLAGPVQYRWMYPFERYLRTLKNHIRNKAQVEASISNAYILEEMSTFSSYYFEDHVTTKWRNLPRNIEESVEDSDDPNQLLIFKPVGRPIGRMTKRYMDPKEYMAAHMYILSNCAEVANTYIKIFEDEMRYVNPSLTEAELESAFDKDFMLWFGHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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