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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001376`

染色体: Chr04 坐标: 22365800-22367024 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001376`
名称	SmilChr04G001376
描述	uncharacterized SmilChr04G001376
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22365800 - 22367024 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023155`
GeneID	`131023155`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023155`
原始查询	`LOC131023155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=36.2; qcov=0.176; evalue=3.6e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023155

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808682.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808682.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808682.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808682.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808682.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22365800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:22365805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A2,B10,B107,B13,B140,B52,B72,B86,B87,C10,C37,C7,D10
`Chr4:22365856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B132,B60,C40,C52
`Chr4:22365884`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C8
`Chr4:22365884`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C8
`Chr4:22365885`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B131
`Chr4:22365885`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B131
`Chr4:22365889`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A14,A25,B11,B40,B45,B47,B62,C48,C56,C65,D1
`Chr4:22365890`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A7,B1,B114,B12,B130,B23,B29,B38,C19,C45,C72,D7
`Chr4:22365895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B107,B47,C47
`Chr4:22365898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B135,C55
`Chr4:22365900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B25,C82

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952699.1
ATGGCCAAGGAACAAGAGAAGGAAGAACTAACCGAACTGGTGAAAATTTTCAAAAAGGTAGAGGTCAATATGCCCCTGTTGGTCGCGCTACGCTCTATGCCCAGATGCGCGAAATTGCTCAAGGAACTCTGCACTCGGAAGGTCAAATACACTGATGATGCCAAATTTCAAGTGGGCGAATCCGTATCCGCGGTCTTACAACGGGATATGCCCATAAAGTGTGGGGACCCTGGCATGTTCTACATCCAATGTGTAATAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023155
ATGGCCAAGGAACAAGAGAAGGAAGAACTAACCGAACTGGTGAAAATTTTCAAAAAGGTAGAGGTCAATATGCCCCTGTTGGTCGCGCTACGCTCTATGCCCAGATGCGCGAAATTGCTCAAGGAACTCTGCACTCGGAAGGTCAAATACACTGATGATGCCAAATTTCAAGTGGGCGAATCCGTATCCGCGGTCTTACAACGGGATATGCCCATAAAGTGTGGGGACCCTGGCATGTTCTACATCCAATGTGTAATAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808682.1
MAKEQEKEELTELVKIFKKVEVNMPLLVALRSMPRCAKLLKELCTRKVKYTDDAKFQVGESVSAVLQRDMPIKCGDPGMFYIQCVIGTMKVEKAMLDLGASINVMPLSMYQDLEIGPLKPTRVVIQLADRSNVYPDGILEDVLVKVEELIFPADFYILDMGKSKARDPVMLLGRPFLKTARTRIDCDTGKLTCQFEGETVTFDIYNAMKHPTDTEMVKSVDIIKKVVEENGITEEDLQEEHLQEAMKVLNAWSEGVNHTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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