当前解析结果
SmilChr04G001377| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001377 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001377 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001377 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22367109 - 22368650 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023156 |
|---|---|
| GeneID | 131023156 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023156 |
| 原始查询 | LOC131023156 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023156 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808683.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808683.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057808683.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057808683.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808683.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22367127 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 126 | A1,A11,A13,A14,A15,A18,A2,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B103,B105,B108,B109,B111,B118,B119,B121,B123,B124,B127,B128,B13,B136,B137,B138,B139,B14,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B27,B29,B3,B34,B35,B36,B38,B41,B42,B44,B49,B50,B56,B57,B59,B6,B61,B64,B65,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B94,C1,C14,C15,C16,C18,C19,C23,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C34,C36,C38,C41,C42,C44,C45,C46,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C58,C59,C6,C62,C64,C67,C68,C70,C71,C74,C80,C81,C82,C84,C86,D3,D4,D5,D6,D8,D9 |
Chr4:22367138 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B114,B76,B8,B93 |
Chr4:22367147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr4:22367174 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B118 |
Chr4:22367174 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr4:22367192 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B49,B71 |
Chr4:22367241 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B17,C16 |
Chr4:22367243 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr4:22367244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr4:22367246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B54,B77,C29 |
Chr4:22367252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B19,B45,C72 |
Chr4:22367252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B45,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。