当前解析结果
SmilChr04G001382| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001382 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001382 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001382 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22436912 - 22437736 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023158 |
|---|---|
| GeneID | 131023158 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023158 |
| 原始查询 | LOC131023158 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023158 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808686.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808686.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808686.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057808686.1 |
| 5 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057808686.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22436916 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A14 |
Chr4:22436916 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr4:22436932 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:22436950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,C16,C62,D3 |
Chr4:22436989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B68 |
Chr4:22437008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 47 | A18,A21,A23,A24,A9,B101,B106,B107,B112,B119,B126,B132,B135,B26,B31,B42,B43,B53,B57,B60,B71,B88,B9,B93,C11,C13,C27,C32,C40,C42,C43,C45,C47,C53,C54,C55,C61,C68,C69,C7,C74,C77,C86,C87,D10,D11,D8 |
Chr4:22437041 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A1,A5,B105,B120,B131,B20,B32,B33,B55,B62,B67,B68,B70,B71,B77,B80,B81,B92,B98,C15,C18,C36,C44,C49,C51,C6,C60,C62,C66,C67,D2 |
Chr4:22437053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 40 | A1,A21,A23,A5,A9,B105,B106,B107,B112,B119,B120,B126,B132,B15,B31,B42,B43,B53,B55,B60,B67,B68,B70,B71,B80,B81,B93,B98,C13,C32,C42,C43,C45,C47,C61,C66,C68,C7,C77,D8 |
Chr4:22437076 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B114,C2,C22,C52,D3 |
Chr4:22437080 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr4:22437095 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr4:22437098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B98,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。