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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002071`

染色体: Chr01 坐标: 36581969-36584586 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002071`
名称	SmilChr01G002071
描述	uncharacterized SmilChr01G002071
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36581969 - 36584586 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023173`
GeneID	`131023173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023173`
原始查询	`LOC131023173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03078 (ATHILA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808705.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057808705.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808705.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808705.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36582547`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,C71
`Chr1:36582547`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B56,C71
`Chr1:36582548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:36582551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:36582560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C41,D9
`Chr1:36582565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:36582568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B50,B60,C31
`Chr1:36582578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B50,B60,C31
`Chr1:36582579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:36582580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B50,B60,C31,C69
`Chr1:36582595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:36582596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808705.1

497 aa

248

497

ATHILA

PF03078 ATHILA 59-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808705.1`	Pfam	`PF03078`	ATHILA	Domain	59	223	2.1e-19	70.4	ATHILA ORF-1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952722.1
TTTCACACACTAACACCCCAATTCATTTTTTTTCTCTTACTTTCTTCCACCCAATCCATCCAAGTATTCTCAGCATGCCTCCAAAGGGGAAAGCAACCCGGGCCGCCAAGGGAAAGGGCAAAGCCACTGGCTCGTCCTCAAGAAGCAGCCGTGCGGCGCCGCCGGTTTCAGAGTTCTCACCGGCTCACTTCGGTGTGGAACTCCCTGATGATGTCTCACTGAAGAACTGGGAGAAGCTCATCCACATCCCGGTCAAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023173
ATGCCTCCAAAGGGGAAAGCAACCCGGGCCGCCAAGGGAAAGGGCAAAGCCACTGGCTCGTCCTCAAGAAGCAGCCGTGCGGCGCCGCCGGTTTCAGAGTTCTCACCGGCTCACTTCGGTGTGGAACTCCCTGATGATGTCTCACTGAAGAACTGGGAGAAGCTCATCCACATCCCGGTCAAGCCCACAAAGTACATCTGTCCAACCACTGTGGAGAAGTTGGGCATCCAGGATGATGTTTGGGCTATGGTCGATCGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808705.1
MPPKGKATRAAKGKGKATGSSSRSSRAAPPVSEFSPAHFGVELPDDVSLKNWEKLIHIPVKPTKYICPTTVEKLGIQDDVWAMVDRAGLRQVFTGNWHTYRILTIEFLSTLKIKYDRTIPTECQFRLLNKDYGMTCNNFNDILESPRSGIYGVAGFQPQQLWAAMADLTLEDTKHFVTGRAKAKALRNPVFRYIQRVMAYNYFARENVGNLRSDELLHLNCMLTGDKIDLAPQLLDQFHSQLTSPTASIGIGGFVTALAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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