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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001462`

染色体: Chr04 坐标: 24039713-24041299 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001462`
名称	SmilChr04G001462
描述	uncharacterized SmilChr04G001462
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24039713 - 24041299 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023178`
GeneID	`131023178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023178`
原始查询	`LOC131023178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=33; qcov=0.413; evalue=5.67e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808707.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808707.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808707.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808707.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24039718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:24039747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B132,B89,C18,C26
`Chr4:24039750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C38
`Chr4:24039756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B127,B37,B53,C42
`Chr4:24039791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,B65,B91,C38
`Chr4:24039796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:24039796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:24039829`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	121	A14,A15,A16,A18,A19,A20,A4,A6,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B117,B12,B121,B123,B126,B127,B128,B13,B132,B134,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B23,B27,B29,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B5,B50,B52,B53,B55,B57,B60,B61,B64,B7,B72,B73,B77,B78,B80,B83,B84,B87,B9,B91,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C24,C27,C28,C3,C30,C31,C35,C38,C40,C45,C46,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C67,C69,C70,C72,C74,C77,C78,C8,C81,C9,D1,D11,D2,D5,D8,D9
`Chr4:24039852`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr4:24039852`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr4:24039863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B42,B43,C41
`Chr4:24039890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C10,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808707.1

528 aa

264

528

RVT_1

PF00078 RVT_1 366-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808707.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	366	526	1.3e-27	97.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952724.1
ATGATTATTGATGAAGAAAACGGGCCCATATCCAATAGGGCGCGGAAGCAAAACATTCGTTCGTGCAAGGTTGGAATTATGCCCAGTCAGGTCATGAGTGTTCGTAGCGTTGCTAGGGAGCCGAGTAGTTCTTTCGGGCCGGAGGATCACGCCGGGCTGGTTCACCCACATGATGACGCTTTAGTCTTATCTGTGGATGTAGCGTATTGCACTGTGCATCGCATATTTGTAGATTTGGGTAGCGCTCTGAATATAATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023178
ATGATTATTGATGAAGAAAACGGGCCCATATCCAATAGGGCGCGGAAGCAAAACATTCGTTCGTGCAAGGTTGGAATTATGCCCAGTCAGGTCATGAGTGTTCGTAGCGTTGCTAGGGAGCCGAGTAGTTCTTTCGGGCCGGAGGATCACGCCGGGCTGGTTCACCCACATGATGACGCTTTAGTCTTATCTGTGGATGTAGCGTATTGCACTGTGCATCGCATATTTGTAGATTTGGGTAGCGCTCTGAATATAATATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808707.1
MIIDEENGPISNRARKQNIRSCKVGIMPSQVMSVRSVAREPSSSFGPEDHAGLVHPHDDALVLSVDVAYCTVHRIFVDLGSALNIIYKDRLIAMALDATLKLLGNLLYDFTGESILPLGSLELPMTWGKEWASRTRILKILVVDFPKPSYNIIIGRPALNAFQAVISMYHLKMKFSLENDRVGGVIGSQITSKEWCFVKSLTAPVGSKRTQSWQGGPAEKIARAGGSSGNTAKQAEIEEIGRFPEKQPMISTDDRCMLME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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