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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001464`

染色体: Chr04 坐标: 24054346-24057391 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001464`
名称	SmilChr04G001464
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24054346 - 24057391 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023179`
GeneID	`131023179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023179`
原始查询	`LOC131023179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
产物	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
Arabidopsis	`AT4G21160` (ZAC) Calcium-dependent ARF-type GTPase activating protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827864] identity=64.5; qcov=0.775; evalue=9.29e-97; confidence=high
Rice	`Os02g0722500` - identity=58.9; qcov=0.746; evalue=6e-81; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005543 (phospholipid binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808708.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808708.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808708.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808708.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24054490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:24055552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:24055592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:24055651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B17,C81
`Chr4:24057096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:24057096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:24057141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	119	A10,A11,A16,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A5,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B106,B107,B108,B110,B111,B117,B118,B12,B120,B121,B126,B127,B128,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B21,B23,B28,B29,B30,B31,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B54,B55,B60,B62,B63,B65,B67,B7,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B81,B83,B85,B90,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C16,C17,C20,C21,C25,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C34,C36,C39,C4,C42,C5,C50,C58,C59,C60,C62,C65,C69,C70,C71,C72,C73,C75,C78,C79,C80,C84,C86,C87,D5,D7,D8
`Chr4:24057148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A14,A19,A6,B10,B136,B19,B37,B4,B67,B7,B73,B80,B83,B87,B97,C20,C28,C3,C38,C78,C81,D10,D9
`Chr4:24057156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:24057177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:24057389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B34,C12,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808708.1

280 aa

140

280

PF00168 C2 126-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808708.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	126	213	3.1e-23	82.7	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952725.1
ATGCGATTCGAGGTAACTGATGTTGGTGACGCGTGGACAGTCGAATGGGCGTGTCGAATCTTTTTGAATCAAAAGAAATTATCTTCTTTTGAACTTGTACAACACCACTGCTCGGTTAAGGGTAGCCGCAATTCTCCCCTTTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAAAATCAGCAGCTGCAGTATTACTGATTTCTATTCTTTATGTGATCTTTGTAGGTCTAAATACGAGCAGCAAGCATTTTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023179
ATGCGATTCGAGGTAACTGATGTTGGTGACGCGTGGACAGTCGAATGGGCGTGTCGAATCTTTTTGAATCAAAAGAAATTATCTTCTTTTGAACTTGTACAACACCACTGCTCGGTTAAGGGTAGCCGCAATTCTCCCCTTTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAAAATCAGCAGCTGCAGTATTACTGATTTCTATTCTTTATGTGATCTTTGTAGGTCTAAATACGAGCAGCAAGCATTTTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808708.1
MRFEVTDVGDAWTVEWACRIFLNQKKLSSFELVQHHCSVKGSRNSPLSKLSFLSHPLQLKISSCSITDFYSLCDLCRSKYEQQAFLKPSLRIQSGSAKQSLQASLSRKIVNSLRSSNSSENSEYIGTMKVKVLKGSNLAVRDMLSSDPYIVLTLGQQKVQTSVVNSYLNPVWNEELTLSIPHDYSQVKLQVYDHDTFSADDIMGEADIDIQPMITSALAYGDARKFADMQIGKWLKSYDNALIEDSPVNIVAGKVRQDLW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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