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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001476`

染色体: Chr04 坐标: 24201367-24202831 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001476`
名称	SmilChr04G001476
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24201367 - 24202831 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023184`
GeneID	`131023184`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023184`
原始查询	`LOC131023184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29; qcov=0.732; evalue=2.04e-47; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=29.8; qcov=0.829; evalue=5.11e-59; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023184

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808712.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808712.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808712.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808712.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24201373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B135,B40,B7,B85
`Chr4:24201393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C36
`Chr4:24201405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:24201456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B132,C78
`Chr4:24201462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:24201470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr4:24201471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr4:24201559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C14
`Chr4:24201570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:24201571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B124,C76
`Chr4:24201612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:24201620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808712.1

462 aa

231

462

MULE

SWIM

PF10551 MULE 2-65 aa PF04434 SWIM 261-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808712.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	2	65	8.1e-16	58.9	MULE transposase domain
`XP_057808712.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	261	288	0.0001	22.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952729.1
ATGTTTGCAGTTGGCTTCTTGACCAATGAAAGAAGTGAGTCTTACGTGTGGTTGTTTAAAACGTTCCTCGAGGCTATGTATCAAAAAGAGCCGTCAATAATATTCTCAGACCAAGATCAGGCCCTTATGAATGGTGTTGATCACACATTTCGCGAAGCAGCACACAGACTTTGTCAGTGGCATGTTAACAAAAATGCCACGAAGCAATTTGGGCAACTAAACAATGATAAGGGGTTCAAGACTTTGTGGTACCAATGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023184
ATGTTTGCAGTTGGCTTCTTGACCAATGAAAGAAGTGAGTCTTACGTGTGGTTGTTTAAAACGTTCCTCGAGGCTATGTATCAAAAAGAGCCGTCAATAATATTCTCAGACCAAGATCAGGCCCTTATGAATGGTGTTGATCACACATTTCGCGAAGCAGCACACAGACTTTGTCAGTGGCATGTTAACAAAAATGCCACGAAGCAATTTGGGCAACTAAACAATGATAAGGGGTTCAAGACTTTGTGGTACCAATGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808712.1
MFAVGFLTNERSESYVWLFKTFLEAMYQKEPSIIFSDQDQALMNGVDHTFREAAHRLCQWHVNKNATKQFGQLNNDKGFKTLWYQCMNGCESEEEFETTWLSLIVEHNLSENRWFSTMYNLRKRWSSAFTRDKFFGGLHATSRSEVTNKVIKDLCSSTSTVYDFVIGFERILKNWRQTEFEEDTLCRGTPGMFVQQTGILVQVAELCTKSIFRSFEFESLHSVSVKMTHEPPDLNDEVLVFKVFSRSAVTGFRTVRFNQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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