当前解析结果
SmilChr04G001479| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001479 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001479 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001479 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 24221025 - 24221546 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023186 |
|---|---|
| GeneID | 131023186 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023186 |
| 原始查询 | LOC131023186 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=32.2; qcov=0.988; evalue=5.41e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023186 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808714.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808714.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057808714.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057808714.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808714.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:24221036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B52,B74,C43,C56 |
Chr4:24221037 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C18,C22 |
Chr4:24221075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B67,B79,D10,D11,D4 |
Chr4:24221079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr4:24221087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr4:24221182 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:24221202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B28 |
Chr4:24221211 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B56,B68,B81,B96,C6 |
Chr4:24221220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B56,B68,B81,B96,C6 |
Chr4:24221263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B92,D11 |
Chr4:24221287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B43,B60,B79,C86 |
Chr4:24221289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B133,B45 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。