当前解析结果
SmilChr04G001492| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001492 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001492 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001492 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 24375866 - 24376255 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023188 |
|---|---|
| GeneID | 131023188 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023188 |
| 原始查询 | LOC131023188 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023188 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808717.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057808717.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808717.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808717.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808717.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:24375877 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B122,B124,B15,B34,B73,C57 |
Chr4:24375904 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A18,A23,A25,A9,B119,B121,B2,B29,B40,B43,B46,B47,B72,B75,B77,B83,B87,B9,B95,B98,B99,C21,C28,C29,C46,C47,C5,C53,C56,C59,C80,C82,D2,D6,D7 |
Chr4:24375913 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C25 |
Chr4:24375928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 28 | A18,A23,A25,A9,B119,B121,B15,B2,B29,B46,B47,B72,B75,B83,B9,B95,B99,C18,C21,C46,C47,C5,C53,C59,C69,C82,D6,D7 |
Chr4:24375953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr4:24375964 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B67 |
Chr4:24375994 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A14,B121,B127,B137,B47,C1,C15,C34,C60,C64,C69 |
Chr4:24376000 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A10,B105,B117,B125,B127,B18,B4,B42,B43,B56,C11,C16,C23,C41,C43,C49,C69,D3 |
Chr4:24376007 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B40,B73,C11,D9 |
Chr4:24376074 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr4:24376085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B53,C42 |
Chr4:24376106 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。