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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001547`

染色体: Chr04 坐标: 25575924-25578550 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001547`
名称	SmilChr04G001547
描述	uncharacterized SmilChr04G001547
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25575924 - 25578550 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023205`
GeneID	`131023205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023205`
原始查询	`LOC131023205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.1; qcov=0.961; evalue=3.32e-58; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.4; qcov=0.668; evalue=9.88e-54; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808730.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808730.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808730.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808730.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25576115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B90,B97
`Chr4:25576203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:25576376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:25576386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B40,B93,B97
`Chr4:25576470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B30,B99,D9
`Chr4:25576470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B99,D9
`Chr4:25576552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B48,B67,B68,C15
`Chr4:25576554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:25576560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B133,B47
`Chr4:25576578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr4:25576649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B68,C10,C23,C38
`Chr4:25576658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,C1,C25,C39,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808730.1

849 aa

424

849

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 427-526 aa PF10551 MULE 428-522 aa PF04434 SWIM 671-701 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808730.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	427	526	9.8e-11	41.9	Transposase, Mutator family
`XP_057808730.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	428	522	9.9e-21	74.7	MULE transposase domain
`XP_057808730.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	671	701	4.1e-07	30.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952747.1
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGACTGATTTCCGAGCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023205
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGACTGATTTCCGAGCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808730.1
MSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSKEDLCHAKLMQEVHDQLNEDGRSTYMLFYTSTTDEGRRIKVALKTDSDLNRLISEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPIPQTQEQVYYEGHRSTVFPIETDVGRSIPTHDDSRDDSSSQEEENESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGHQNFTSDDQPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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