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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001557`

染色体: Chr04 坐标: 25769628-25772727 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001557`
名称	SmilChr04G001557
描述	uncharacterized SmilChr04G001557
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25769628 - 25772727 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023209`
GeneID	`131023209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023209`
原始查询	`LOC131023209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.9; qcov=0.322; evalue=1e-36; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27; qcov=0.674; evalue=3.2e-60; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808734.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808734.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808734.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808734.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25769639`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A4,A9,B18,B19,B28,B71,B75,B78,B9,B93,B99,C17,C19,C30,C31,C35,C46,C49,C53,D7
`Chr4:25769660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B2,C11,C69
`Chr4:25769661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A1,A14,A19,A7,B10,B107,B109,B11,B111,B112,B120,B124,B129,B15,B19,B20,B26,B29,B38,B40,B41,B5,B54,B58,B65,B66,B7,B73,B75,B79,B80,B91,B93,B94,B97,C12,C15,C20,C24,C29,C3,C36,C38,C5,C51,C55,C56,C60,C66,C7,C70,C77,C8,C80,C81,C82,D10,D11,D2
`Chr4:25769662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B50
`Chr4:25769662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:25769676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C71
`Chr4:25769682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A16,B122,B2,B30,B83,C11,C34,C49,C59,C69,C79
`Chr4:25769697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:25769702`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B17,B48,B74,C49
`Chr4:25769702`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B17,B48,B74,C49
`Chr4:25769707`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B17,B48,B74,C49
`Chr4:25769707`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B17,B48,B74,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808734.1

895 aa

448

895

RVT_1

RVT_3

PF00078 RVT_1 135-339 aa PF13456 RVT_3 753-868 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808734.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	135	339	1.2e-18	68.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057808734.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	753	868	3.3e-14	53.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952751.1
ATGACAGAGGCGGAGGAAGTACATTGGAAACAGAGATCCCGATCCAACTGGCACAGCCTGGGCGACAGAAATTCAAAGTACTTCCATGCCTTCGCTAGTAAACAAAAAAAGAATAACACTATCTCTAGCTTCACTGATAAGTACGGCTCGGAGGTGAAGAAGGCTGAAGAAATGGCAGCTGTTATCCATGAGTATTTTGTTGAGCTCTTCGCTTCTAATGGGGCTGATCCGGTTCAGATCGACAAAGTTACTAACAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023209
ATGACAGAGGCGGAGGAAGTACATTGGAAACAGAGATCCCGATCCAACTGGCACAGCCTGGGCGACAGAAATTCAAAGTACTTCCATGCCTTCGCTAGTAAACAAAAAAAGAATAACACTATCTCTAGCTTCACTGATAAGTACGGCTCGGAGGTGAAGAAGGCTGAAGAAATGGCAGCTGTTATCCATGAGTATTTTGTTGAGCTCTTCGCTTCTAATGGGGCTGATCCGGTTCAGATCGACAAAGTTACTAACAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808734.1
MTEAEEVHWKQRSRSNWHSLGDRNSKYFHAFASKQKKNNTISSFTDKYGSEVKKAEEMAAVIHEYFVELFASNGADPVQIDKVTNSGSPYLGESSIGELDKMFTESEIRKAIFQIYSHKAPGPDGYLPLFSNDSKVLANRLRTILNSVIDDYQCAFIPERLISDNIILGYECMHWIRGKKNGKEGVATAKLDMSKAYDRVKWRFLRAMMVVMRFSLPIINLVMQCISMVVFSFVINHKVYGNLIMSRGLRQGCPLSSFLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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