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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001629`

染色体: Chr04 坐标: 27044852-27046815 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001629`
名称	SmilChr04G001629
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27044852 - 27046815 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023218`
GeneID	`131023218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023218`
原始查询	`LOC131023218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27.7; qcov=0.771; evalue=7.42e-59; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=26.9; qcov=0.702; evalue=6.38e-55; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808743.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808743.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808743.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808743.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808743.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27044919`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A15,A18,A23,A4,A9,B10,B122,B137,B14,B15,B32,B50,B53,B74,B87,B99,C14,C17,C2,C25,C28,C30,C33,C35,C39,C43,C45,C46,C53,C57,C64,C66,C71,C74,C78,D9
`Chr4:27044934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B138,B24,B91
`Chr4:27044944`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B91
`Chr4:27044944`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B91
`Chr4:27044954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B66,D5
`Chr4:27044969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B66,D5
`Chr4:27044983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B66,D5
`Chr4:27045044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B66,D5
`Chr4:27045164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr4:27045175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr4:27045182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr4:27045209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808743.1

608 aa

304

608

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 96-202 aa PF10551 MULE 124-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808743.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	96	202	9.1e-09	36.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057808743.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	124	214	1.1e-24	87.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952760.1
ATGGTTCCTGAAGCTACACGACATTTGATGAGCAACTACAGGAATGTTGATGAATTCCAACAGATGTTCATAATTTCAGCTGTAAAAGCTAATATTGGGCCAATGCGTGCCTTTCGATTTTTCAGAGAGATTGTAGGCGATTATAAATCAGTTGGATGTACCGGCACCGACTTCAAGAACTTTGTAAGGGACCTGAAGGTATATTCGTTCGGATCAGATGCACATATGCTGTTGGAAACACTTAATAACAAACAGCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023218
ATGGTTCCTGAAGCTACACGACATTTGATGAGCAACTACAGGAATGTTGATGAATTCCAACAGATGTTCATAATTTCAGCTGTAAAAGCTAATATTGGGCCAATGCGTGCCTTTCGATTTTTCAGAGAGATTGTAGGCGATTATAAATCAGTTGGATGTACCGGCACCGACTTCAAGAACTTTGTAAGGGACCTGAAGGTATATTCGTTCGGATCAGATGCACATATGCTGTTGGAAACACTTAATAACAAACAGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808743.1
MVPEATRHLMSNYRNVDEFQQMFIISAVKANIGPMRAFRFFREIVGDYKSVGCTGTDFKNFVRDLKVYSFGSDAHMLLETLNNKQQLRDGFKFFHEVDDEKKLCRIIWADDVSVKNYKLFGEAVSFDATYNTNRYKFILTPFTGKDNHGRCISFAVALINHEDSESYAWVLEKFELIMGNAPRILITDQDPGLKKAVASTWKETRHRFCMWHINIRVAEKVPQRLRDDTDFKLVYDRVVWNDNDEPEVFEENWNNLMEEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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