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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001695`

染色体: Chr04 坐标: 28001550-28003153 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001695`
名称	SmilChr04G001695
描述	uncharacterized SmilChr04G001695
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28001550 - 28003153 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023230`
GeneID	`131023230`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023230`
原始查询	`LOC131023230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023230

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808754.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808754.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808754.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808754.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28001640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,C30,C49,C53,C57
`Chr4:28001664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B133,B73,B79,C62
`Chr4:28001665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28001705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B133,B73,B79
`Chr4:28001724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B133,B73,B79
`Chr4:28001742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28001905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A10,A14,A16,A21,A5,A7,B101,B102,B103,B106,B114,B123,B130,B132,B138,B139,B15,B22,B6,B61,B8,B88,B95,C1,C14,C15,C17,C25,C37,C43,C48,C49,C61,C71,C82,D3
`Chr4:28001912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,C11,C74
`Chr4:28001914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C55,C61,C83
`Chr4:28001928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A8,B11,C34
`Chr4:28001928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B11,C34
`Chr4:28001956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B109,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808754.1

347 aa

174

347

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 161-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808754.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	161	300	3e-23	83.2	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952771.1
ATGGTGGGAGGAGGTTCTAGTGCGAGAGGAGGTTCTAGTGGTAGGGGTGCTGCATCATCCGCAGGACACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGGTGCATCTGTACGGGATATACATCTGACTCATTCACATTCATCTTCGGCATCGGTCCCTACTGAGGCATCAGAGGCTACACAGACTGGACGTACTACACTCATCATCAAATATGGGAAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCATCCGTAGTCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023230
ATGGTGGGAGGAGGTTCTAGTGCGAGAGGAGGTTCTAGTGGTAGGGGTGCTGCATCATCCGCAGGACACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGGTGCATCTGTACGGGATATACATCTGACTCATTCACATTCATCTTCGGCATCGGTCCCTACTGAGGCATCAGAGGCTACACAGACTGGACGTACTACACTCATCATCAAATATGGGAAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCATCCGTAGTCACTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808754.1
MVGGGSSARGGSSGRGAASSAGHPTSSTGSDGGIGASVRDIHLTHSHSSSASVPTEASEATQTGRTTLIIKYGKLHPLGMVPSVVTKIFKQVQNPEGYNWKLTPLSVKTAYFEEFKEHFTWDAAIESTVYKLWHACAARRYSDFVHDIKERRSKRPPFIHEDHWPNWIKYWDSDEVKAKSEIAKKCRMSEPLGPRTGQAKRKGGSRSILQYAEEVGKRKGVEPTECLYDAYEILHKNKDGTYTDERSRRIGEKVQDIVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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