当前解析结果
SmilChr04G001711| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001711 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001711 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001711 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 28281282 - 28281974 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023234 |
|---|---|
| GeneID | 131023234 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023234 |
| 原始查询 | LOC131023234 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0484800- identity=23.6; qcov=0.865; evalue=1.06e-07; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023234 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808757.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057808757.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057808757.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808757.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808757.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:28281323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B54,C19 |
Chr4:28281370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:28281371 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr4:28281372 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B57,B88,C27,C55,C73 |
Chr4:28281375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:28281378 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28281379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C81 |
Chr4:28281389 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28281426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28281461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr4:28281489 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A21,B105,B112,B13,B18 |
Chr4:28281489 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B105,B112,B13,B18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。