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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001723`

染色体: Chr04 坐标: 28489282-28493169 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001723`
名称	SmilChr04G001723
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28489282 - 28493169 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023237`
GeneID	`131023237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023237`
原始查询	`LOC131023237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=33; qcov=0.849; evalue=4.61e-25; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24769 (At2g29880_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808761.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808761.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808761.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808761.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28489284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B130,B33,B69,B80
`Chr4:28489302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B22,B53,C42
`Chr4:28489312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:28489321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A13,A20,A22,A7,B1,B104,B11,B110,B120,B139,B19,B52,B57,B58,B64,B74,B8,B86,B90,B92,B97,C1,C10,C28,C36,C49,C50
`Chr4:28489333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:28489334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B131,C2,C37
`Chr4:28489339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B11,C17,C63
`Chr4:28489344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B22,B53,B91,C42
`Chr4:28489351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:28489352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:28489358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B131,C2,C37
`Chr4:28489369`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808761.1

311 aa

156

311

At2g29880_C

PF24769 At2g29880_C 263-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808761.1`	Pfam	`PF24769`	At2g29880_C	Domain	263	307	1.8e-11	45.0	At2g29880 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952778.1
ATGCTAAGGTTCAATCCTTCGTCCTCTTCAGAGGAGAATCGAGCAGGAAGCGGCTCTCCGGCCGGGTGTGGCTGCACTGGAGCCAAGGATTGGCTGCTTGTCGGCCTTTTAGCAGTGGTGGTGACGATTTCGCCGTATTTGAGAGAAAGAGGCGACTCCTCATCGAGAAAAGCTAGGGCTCACGATCTGTCACAGATTGAGAGAGAGAGCATGCGGTGGGTGTCGTTGGCGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGTTATGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023237
ATGCTAAGGTTCAATCCTTCGTCCTCTTCAGAGGAGAATCGAGCAGGAAGCGGCTCTCCGGCCGGGTGTGGCTGCACTGGAGCCAAGGATTGGCTGCTTGTCGGCCTTTTAGCAGTGGTGGTGACGATTTCGCCGTATTTGAGAGAAAGAGGCGACTCCTCATCGAGAAAAGCTAGGGCTCACGATCTGTCACAGATTGAGAGAGAGAGCATGCGGTGGGTGTCGTTGGCGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGTTATGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808761.1
MLRFNPSSSSEENRAGSGSPAGCGCTGAKDWLLVGLLAVVVTISPYLRERGDSSSRKARAHDLSQIERESMRWVSLAKFNSGFGYDNDTKKFTAPDEVWDAYIEAHPKDAYLRTERFSDFDDLRLAVGNGVAVGRNAIGVGNATDARTIGVDESRGPLIEELNYDAANEAFVVLGEDDPPLSGSKSPLESTEVPVESTQRRAPAKRSRGQFETNSGHTENSLHQELMVEIKKVTSTMDRVESLFVKRDTMLERREKEKGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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