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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001762`

染色体: Chr04 坐标: 28986775-28987281 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001762`
名称	SmilChr04G001762
描述	uncharacterized SmilChr04G001762
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28986775 - 28987281 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023245`
GeneID	`131023245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023245`
原始查询	`LOC131023245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823332]; symbol=AT3G42860; hit=AT3G42860; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823332]; symbol=AT3G42860; hit=AT3G42860; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G42860` (AT3G42860) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823332] identity=40.7; qcov=0.415; evalue=6.31e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808768.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057808768.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808768.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808768.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28986806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B140,B37,B52,D2
`Chr4:28986812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B56,B88,C50
`Chr4:28986839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28986876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:28986879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B7,B85,C39
`Chr4:28986880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A13,B115,B139,B17,B18,B27,B36,B40,B44,B58,B6,B62,B97,C31,C52,C59,C6,C81,C82
`Chr4:28986897`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A1,A10,A13,A18,A4,B100,B109,B118,B132,B137,B43,B5,B51,B65,B66,B7,B77,B83,B97,C11,C15,C22,C30,C35,C43,C45,C47,C5,C59,C67,C69,C71,C72,C76,C8,C87,D6
`Chr4:28986900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B119,B59,B89,C33
`Chr4:28986901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A2,B10,B107,B109,B120,B15,B2,B27,B28,B37,B52,B54,B59,B63,B66,B68,B83,B86,C18,C22,C34,C38,C42,C43,C85
`Chr4:28987053`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C28,C5
`Chr4:28987053`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C28,C5
`Chr4:28987065`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B36,B55,B78,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808768.1

142 aa

142

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 23-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808768.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	23	62	4.3e-11	43.4	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952785.1
ATGAAGTTCACGACATCTGCCTCCTCTTATGGCGCCTCGTCCATGACTACACCCGATTTCTTCCCTGAATGCGCGTGCAAACTTCAAGTAGAGATGAAAACGTCGCGAACACAGCTCAATCCTGGGCGAAGATTCTTGAGATGCTCCAACAAAGAGAAACAATGTGGCTTCTTTGAGTGGGTAGATCCTGAAGTAAAGCCTAAAATTGAAGATGACGAAGATGAAAAATTGAACTTCTGGATTGGAGAATGCTATCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023245
ATGAAGTTCACGACATCTGCCTCCTCTTATGGCGCCTCGTCCATGACTACACCCGATTTCTTCCCTGAATGCGCGTGCAAACTTCAAGTAGAGATGAAAACGTCGCGAACACAGCTCAATCCTGGGCGAAGATTCTTGAGATGCTCCAACAAAGAGAAACAATGTGGCTTCTTTGAGTGGGTAGATCCTGAAGTAAAGCCTAAAATTGAAGATGACGAAGATGAAAAATTGAACTTCTGGATTGGAGAATGCTATCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808768.1
MKFTTSASSYGASSMTTPDFFPECACKLQVEMKTSRTQLNPGRRFLRCSNKEKQCGFFEWVDPEVKPKIEDDEDEKLNFWIGECYLLGKYVEEDMKRIRLLENEVRLLRMENVESSKCSMKKMVACACVLGVVCLVIQAFVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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