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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001766`

染色体: Chr04 坐标: 29015064-29016543 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001766`
名称	SmilChr04G001766
描述	uncharacterized SmilChr04G001766
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29015064 - 29016543 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023248`
GeneID	`131023248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023248`
原始查询	`LOC131023248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.6; qcov=0.463; evalue=1.35e-42; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808772.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057808772.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057808772.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808772.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29015068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C53
`Chr4:29015114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B17,C73,C84
`Chr4:29015154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29015171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64
`Chr4:29015193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A13,B34,B75,B82,B85,B86,C33,C36,C4
`Chr4:29015201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C53
`Chr4:29015238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C61
`Chr4:29015275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:29015358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A14,A8,B104,B113,B115,B129,B138,B16,B17,B18,B21,B25,B32,B34,B65,B70,B72,C18,C20,C22,C23,C25,C27,C3,C47,C51,C54,C6,C7,C70,C73,C84,C9,D10,D8
`Chr4:29015383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C52,C56
`Chr4:29015399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B119,C31
`Chr4:29015399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808772.1

460 aa

230

460

DUF7769

PF24964 DUF7769 7-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808772.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	7	61	1e-09	38.6	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952789.1
ATGAGACCTCCCAAGGATCTCTCTAACAAAGATCGAAATAAGATTGTGCAGTATCTTCTTGCAAATTTGAAGAATGGCAAGCCTCGGTACGGAGCCATGATGGAGGCGGCATCCCTCTTCAACACTTCACAACGTACGATTACTCGTCTTTGGGCGGCTGCAAAAAAACAAAAGGAGAATGGTCAAGAAATTTATCTAGCCAATGCCAAACCAGGTGCAACAAGAAGAAAAAGAATACAAGTCCACATAGAGCTGATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023248
ATGAGACCTCCCAAGGATCTCTCTAACAAAGATCGAAATAAGATTGTGCAGTATCTTCTTGCAAATTTGAAGAATGGCAAGCCTCGGTACGGAGCCATGATGGAGGCGGCATCCCTCTTCAACACTTCACAACGTACGATTACTCGTCTTTGGGCGGCTGCAAAAAAACAAAAGGAGAATGGTCAAGAAATTTATCTAGCCAATGCCAAACCAGGTGCAACAAGAAGAAAAAGAATACAAGTCCACATAGAGCTGATACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808772.1
MRPPKDLSNKDRNKIVQYLLANLKNGKPRYGAMMEAASLFNTSQRTITRLWAAAKKQKENGQEIYLANAKPGATRRKRIQVHIELIQSLELRKRSTIRRLAVGINQSKSTVWRWVNKGLIRAHSSAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEALEFDRIMSAVKFKTMDNTIHVDEKWFYITKASNRFYLTPGEGDPHRTCKNKAFIKKVIFVCAVCRPVFSHSGECLFDGKIGIFPLIEQLPAKRNSKNRPVGTMETKPIQFVTKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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