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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001778`

染色体: Chr04 坐标: 29207870-29210424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001778`
名称	SmilChr04G001778
描述	uncharacterized SmilChr04G001778
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29207870 - 29210424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023253`
GeneID	`131023253`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023253`
原始查询	`LOC131023253`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842932]; symbol=MMD1; hit=AT1G66170; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842932]; symbol=MMD1; hit=AT1G66170; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G66170` (MMD1) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842932] identity=42.7; qcov=0.41; evalue=3.82e-22; confidence=low
Rice	`Os03g0716200` - identity=45.1; qcov=0.35; evalue=1.7e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023253

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808778.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808778.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057808778.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808778.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29208109`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B133,B68,B71,C10,C50
`Chr4:29208109`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B133,B68,B71,C10,C50
`Chr4:29208137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A1,A11,A24,B10,B108,B112,B119,B123,B125,B126,B13,B130,B135,B18,B3,B31,B36,B37,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B66,B7,B81,B82,B88,B92,B94,B95,C16,C24,C26,C34,C35,C56,C57,C59,C67,C72,C77,D11,D4,D7
`Chr4:29208138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B33
`Chr4:29208138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:29208149`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B92,C57
`Chr4:29208149`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B92,C57
`Chr4:29208153`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C57
`Chr4:29208153`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C57
`Chr4:29209785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,B27,C60
`Chr4:29209792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr4:29209792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952795.1
ATGCTGGAGAAGCAGAGTTGGCCGAAGGTTGGTGAGTTGAACACTCAGTTTGAGAAATGCCAACTCCATTGCTGGTACAATCAAAACCAAATCAACTGTTGGGGTCACCATTTTGTTTGCAAGCGAAAGTACCATTTTATAATTCATGCAAAAGAAGATTGGAATGAGTCATTGGACGAAGATTTTGCGGAACTTGAGAGCCATCACTTGTACAGATTGATTCACTGCAATGGATTCGAGCATCTCATCTGCATCAACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023253
ATGCTGGAGAAGCAGAGTTGGCCGAAGGTTGGTGAGTTGAACACTCAGTTTGAGAAATGCCAACTCCATTGCTGGTACAATCAAAACCAAATCAACTGTTGGGGTCACCATTTTGTTTGCAAGCGAAAGTACCATTTTATAATTCATGCAAAAGAAGATTGGAATGAGTCATTGGACGAAGATTTTGCGGAACTTGAGAGCCATCACTTGTACAGATTGATTCACTGCAATGGATTCGAGCATCTCATCTGCATCAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808778.1
MLEKQSWPKVGELNTQFEKCQLHCWYNQNQINCWGHHFVCKRKYHFIIHAKEDWNESLDEDFAELESHHLYRLIHCNGFEHLICINGLKYNSNLFCTKDSIEFWNHLCTLLRARFSFLQHMRFYQSSDLGETTPMRFEKLVDSMRKRWWPTRRLEHVLLVIVDLLKEHKNESRARMWHVATRIERRGEEVDCGHWLDQFHAQFDKLFYSEESDHPSCHESLFHVVFDENFGDII

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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